Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
BBS2Q9BXC9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BBS2Q9BXC9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BBS2Q9BXC9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BBS2Q9BXC9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BBS2Q9BXC9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BBS2Q9BXC9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BBS2Q9BXC9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BBS2Q9BXC9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
BBS2Q9BXC9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BBS2Q9BXC9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BBS2Q9BXC9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BBS2Q9BXC9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BBS2Q9BXC9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
BBS2Q9BXC9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BBS2Q9BXC9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BBS2Q9BXC9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BBS2Q9BXC9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BBS2Q9BXC9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BBS2Q9BXC9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BBS2Q9BXC9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BBS2Q9BXC9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BBS2Q9BXC9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BBS2Q9BXC9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BBS2Q9BXC9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BBS2Q9BXC9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BBS2Q9BXC9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BBS2Q9BXC9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BBS2Q9BXC9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BBS2Q9BXC9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BBS2Q9BXC9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BBS2Q9BXC9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BBS2Q9BXC9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BBS2Q9BXC9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BBS2Q9BXC9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BBS2Q9BXC9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BBS2Q9BXC9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BBS2Q9BXC9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BBS2Q9BXC9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BBS2Q9BXC9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BBS2Q9BXC9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BBS2Q9BXC9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BBS2Q9BXC9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BBS2Q9BXC9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BBS2Q9BXC9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BBS2Q9BXC9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BBS2Q9BXC9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BBS2Q9BXC9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BBS2Q9BXC9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BBS2Q9BXC9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BBS2Q9BXC9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BBS2Q9BXC9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BBS2Q9BXC9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BBS2Q9BXC9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BBS2Q9BXC9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BBS2Q9BXC9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BBS2Q9BXC9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BBS2Q9BXC9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BBS2Q9BXC9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BBS2Q9BXC9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BBS2Q9BXC9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BBS2Q9BXC9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BBS2Q9BXC9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BBS2Q9BXC9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BBS2Q9BXC9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BBS2Q9BXC9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BBS2Q9BXC9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BBS2Q9BXC9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BBS2Q9BXC9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BBS2Q9BXC9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BBS2Q9BXC9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBS2Q9BXC9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBS2Q9BXC9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BBS2Q9BXC9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBS2Q9BXC9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBS2Q9BXC9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBS2Q9BXC9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BBS2Q9BXC9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBS2Q9BXC9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBS2Q9BXC9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBS2Q9BXC9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBS2Q9BXC9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBS2Q9BXC9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBS2Q9BXC9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BBS2Q9BXC9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BBS2Q9BXC9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BBS2Q9BXC9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BBS2Q9BXC9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BBS2Q9BXC9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BBS2Q9BXC9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BBS2Q9BXC9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BBS2Q9BXC9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BBS2Q9BXC9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BBS2Q9BXC9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BBS2Q9BXC9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BBS2Q9BXC9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BBS2Q9BXC9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BBS2Q9BXC9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BBS2Q9BXC9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BBS2Q9BXC9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms