Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIOK2Q9BVS4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIOK2Q9BVS4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIOK2Q9BVS4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIOK2Q9BVS4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIOK2Q9BVS4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIOK2Q9BVS4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIOK2Q9BVS4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIOK2Q9BVS4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIOK2Q9BVS4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIOK2Q9BVS4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIOK2Q9BVS4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIOK2Q9BVS4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RIOK2Q9BVS4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIOK2Q9BVS4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIOK2Q9BVS4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIOK2Q9BVS4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIOK2Q9BVS4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIOK2Q9BVS4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIOK2Q9BVS4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIOK2Q9BVS4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIOK2Q9BVS4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIOK2Q9BVS4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIOK2Q9BVS4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIOK2Q9BVS4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIOK2Q9BVS4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RIOK2Q9BVS4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIOK2Q9BVS4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIOK2Q9BVS4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIOK2Q9BVS4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIOK2Q9BVS4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIOK2Q9BVS4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIOK2Q9BVS4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIOK2Q9BVS4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIOK2Q9BVS4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RIOK2Q9BVS4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RIOK2Q9BVS4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIOK2Q9BVS4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIOK2Q9BVS4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIOK2Q9BVS4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIOK2Q9BVS4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIOK2Q9BVS4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIOK2Q9BVS4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RIOK2Q9BVS4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIOK2Q9BVS4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIOK2Q9BVS4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIOK2Q9BVS4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIOK2Q9BVS4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIOK2Q9BVS4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIOK2Q9BVS4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIOK2Q9BVS4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RIOK2Q9BVS4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RIOK2Q9BVS4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIOK2Q9BVS4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIOK2Q9BVS4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIOK2Q9BVS4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIOK2Q9BVS4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIOK2Q9BVS4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIOK2Q9BVS4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIOK2Q9BVS4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIOK2Q9BVS4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIOK2Q9BVS4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIOK2Q9BVS4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RIOK2Q9BVS4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIOK2Q9BVS4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIOK2Q9BVS4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIOK2Q9BVS4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIOK2Q9BVS4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIOK2Q9BVS4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIOK2Q9BVS4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIOK2Q9BVS4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIOK2Q9BVS4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIOK2Q9BVS4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIOK2Q9BVS4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIOK2Q9BVS4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIOK2Q9BVS4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIOK2Q9BVS4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIOK2Q9BVS4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIOK2Q9BVS4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIOK2Q9BVS4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RIOK2Q9BVS4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.8 ms