Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SHANK2-AS3Q9BTD1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SHANK2-AS3Q9BTD1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHANK2-AS3Q9BTD1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHANK2-AS3Q9BTD1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHANK2-AS3Q9BTD1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHANK2-AS3Q9BTD1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHANK2-AS3Q9BTD1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHANK2-AS3Q9BTD1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHANK2-AS3Q9BTD1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SHANK2-AS3Q9BTD1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHANK2-AS3Q9BTD1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHANK2-AS3Q9BTD1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHANK2-AS3Q9BTD1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHANK2-AS3Q9BTD1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHANK2-AS3Q9BTD1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHANK2-AS3Q9BTD1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHANK2-AS3Q9BTD1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHANK2-AS3Q9BTD1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHANK2-AS3Q9BTD1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHANK2-AS3Q9BTD1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHANK2-AS3Q9BTD1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHANK2-AS3Q9BTD1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHANK2-AS3Q9BTD1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHANK2-AS3Q9BTD1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SHANK2-AS3Q9BTD1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SHANK2-AS3Q9BTD1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SHANK2-AS3Q9BTD1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SHANK2-AS3Q9BTD1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SHANK2-AS3Q9BTD1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SHANK2-AS3Q9BTD1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHANK2-AS3Q9BTD1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHANK2-AS3Q9BTD1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHANK2-AS3Q9BTD1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHANK2-AS3Q9BTD1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHANK2-AS3Q9BTD1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHANK2-AS3Q9BTD1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHANK2-AS3Q9BTD1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SHANK2-AS3Q9BTD1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms