Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GORASP1Q9BQQ3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GORASP1Q9BQQ3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GORASP1Q9BQQ3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GORASP1Q9BQQ3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GORASP1Q9BQQ3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GORASP1Q9BQQ3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GORASP1Q9BQQ3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GORASP1Q9BQQ3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GORASP1Q9BQQ3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GORASP1Q9BQQ3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GORASP1Q9BQQ3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GORASP1Q9BQQ3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GORASP1Q9BQQ3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GORASP1Q9BQQ3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GORASP1Q9BQQ3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GORASP1Q9BQQ3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GORASP1Q9BQQ3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GORASP1Q9BQQ3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GORASP1Q9BQQ3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GORASP1Q9BQQ3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GORASP1Q9BQQ3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GORASP1Q9BQQ3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GORASP1Q9BQQ3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GORASP1Q9BQQ3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GORASP1Q9BQQ3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GORASP1Q9BQQ3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GORASP1Q9BQQ3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GORASP1Q9BQQ3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GORASP1Q9BQQ3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GORASP1Q9BQQ3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GORASP1Q9BQQ3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GORASP1Q9BQQ3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GORASP1Q9BQQ3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GORASP1Q9BQQ3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GORASP1Q9BQQ3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GORASP1Q9BQQ3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GORASP1Q9BQQ3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GORASP1Q9BQQ3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GORASP1Q9BQQ3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GORASP1Q9BQQ3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GORASP1Q9BQQ3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GORASP1Q9BQQ3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GORASP1Q9BQQ3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GORASP1Q9BQQ3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GORASP1Q9BQQ3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GORASP1Q9BQQ3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GORASP1Q9BQQ3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GORASP1Q9BQQ3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GORASP1Q9BQQ3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GORASP1Q9BQQ3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GORASP1Q9BQQ3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GORASP1Q9BQQ3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GORASP1Q9BQQ3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GORASP1Q9BQQ3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GORASP1Q9BQQ3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GORASP1Q9BQQ3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GORASP1Q9BQQ3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GORASP1Q9BQQ3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GORASP1Q9BQQ3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GORASP1Q9BQQ3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GORASP1Q9BQQ3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GORASP1Q9BQQ3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GORASP1Q9BQQ3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GORASP1Q9BQQ3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GORASP1Q9BQQ3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GORASP1Q9BQQ3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GORASP1Q9BQQ3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GORASP1Q9BQQ3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GORASP1Q9BQQ3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GORASP1Q9BQQ3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GORASP1Q9BQQ3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GORASP1Q9BQQ3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GORASP1Q9BQQ3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GORASP1Q9BQQ3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GORASP1Q9BQQ3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GORASP1Q9BQQ3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GORASP1Q9BQQ3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GORASP1Q9BQQ3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GORASP1Q9BQQ3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GORASP1Q9BQQ3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GORASP1Q9BQQ3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GORASP1Q9BQQ3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GORASP1Q9BQQ3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GORASP1Q9BQQ3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GORASP1Q9BQQ3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GORASP1Q9BQQ3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GORASP1Q9BQQ3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GORASP1Q9BQQ3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GORASP1Q9BQQ3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GORASP1Q9BQQ3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GORASP1Q9BQQ3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GORASP1Q9BQQ3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GORASP1Q9BQQ3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GORASP1Q9BQQ3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GORASP1Q9BQQ3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GORASP1Q9BQQ3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GORASP1Q9BQQ3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GORASP1Q9BQQ3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GORASP1Q9BQQ3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms