Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CMSS1Q9BQ75 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CMSS1Q9BQ75 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CMSS1Q9BQ75 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CMSS1Q9BQ75 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CMSS1Q9BQ75 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CMSS1Q9BQ75 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CMSS1Q9BQ75 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CMSS1Q9BQ75 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CMSS1Q9BQ75 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CMSS1Q9BQ75 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CMSS1Q9BQ75 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CMSS1Q9BQ75 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CMSS1Q9BQ75 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CMSS1Q9BQ75 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CMSS1Q9BQ75 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CMSS1Q9BQ75 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CMSS1Q9BQ75 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CMSS1Q9BQ75 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CMSS1Q9BQ75 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CMSS1Q9BQ75 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CMSS1Q9BQ75 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CMSS1Q9BQ75 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CMSS1Q9BQ75 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CMSS1Q9BQ75 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CMSS1Q9BQ75 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CMSS1Q9BQ75 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CMSS1Q9BQ75 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CMSS1Q9BQ75 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CMSS1Q9BQ75 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CMSS1Q9BQ75 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CMSS1Q9BQ75 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CMSS1Q9BQ75 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CMSS1Q9BQ75 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CMSS1Q9BQ75 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CMSS1Q9BQ75 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CMSS1Q9BQ75 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CMSS1Q9BQ75 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CMSS1Q9BQ75 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CMSS1Q9BQ75 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CMSS1Q9BQ75 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CMSS1Q9BQ75 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CMSS1Q9BQ75 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CMSS1Q9BQ75 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CMSS1Q9BQ75 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CMSS1Q9BQ75 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CMSS1Q9BQ75 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CMSS1Q9BQ75 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMSS1Q9BQ75 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMSS1Q9BQ75 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMSS1Q9BQ75 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMSS1Q9BQ75 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMSS1Q9BQ75 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMSS1Q9BQ75 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMSS1Q9BQ75 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMSS1Q9BQ75 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMSS1Q9BQ75 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMSS1Q9BQ75 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMSS1Q9BQ75 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMSS1Q9BQ75 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMSS1Q9BQ75 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMSS1Q9BQ75 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMSS1Q9BQ75 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMSS1Q9BQ75 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMSS1Q9BQ75 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMSS1Q9BQ75 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMSS1Q9BQ75 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CMSS1Q9BQ75 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CMSS1Q9BQ75 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CMSS1Q9BQ75 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CMSS1Q9BQ75 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CMSS1Q9BQ75 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CMSS1Q9BQ75 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CMSS1Q9BQ75 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CMSS1Q9BQ75 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CMSS1Q9BQ75 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CMSS1Q9BQ75 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CMSS1Q9BQ75 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CMSS1Q9BQ75 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CMSS1Q9BQ75 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CMSS1Q9BQ75 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CMSS1Q9BQ75 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CMSS1Q9BQ75 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CMSS1Q9BQ75 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CMSS1Q9BQ75 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CMSS1Q9BQ75 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CMSS1Q9BQ75 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CMSS1Q9BQ75 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CMSS1Q9BQ75 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CMSS1Q9BQ75 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CMSS1Q9BQ75 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CMSS1Q9BQ75 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CMSS1Q9BQ75 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CMSS1Q9BQ75 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CMSS1Q9BQ75 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CMSS1Q9BQ75 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CMSS1Q9BQ75 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CMSS1Q9BQ75 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CMSS1Q9BQ75 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CMSS1Q9BQ75 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms