Protein–RNA interactions for Protein: Q99732

LITAF, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LITAFQ99732 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LITAFQ99732 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LITAFQ99732 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LITAFQ99732 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LITAFQ99732 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LITAFQ99732 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LITAFQ99732 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LITAFQ99732 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LITAFQ99732 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LITAFQ99732 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LITAFQ99732 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LITAFQ99732 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LITAFQ99732 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LITAFQ99732 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LITAFQ99732 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LITAFQ99732 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LITAFQ99732 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LITAFQ99732 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LITAFQ99732 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LITAFQ99732 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LITAFQ99732 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms