Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNGAP1Q96PV0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNGAP1Q96PV0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNGAP1Q96PV0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNGAP1Q96PV0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNGAP1Q96PV0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNGAP1Q96PV0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNGAP1Q96PV0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNGAP1Q96PV0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNGAP1Q96PV0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNGAP1Q96PV0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNGAP1Q96PV0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNGAP1Q96PV0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SYNGAP1Q96PV0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SYNGAP1Q96PV0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SYNGAP1Q96PV0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SYNGAP1Q96PV0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
SYNGAP1Q96PV0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYNGAP1Q96PV0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYNGAP1Q96PV0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNGAP1Q96PV0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNGAP1Q96PV0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNGAP1Q96PV0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNGAP1Q96PV0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNGAP1Q96PV0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNGAP1Q96PV0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNGAP1Q96PV0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNGAP1Q96PV0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNGAP1Q96PV0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNGAP1Q96PV0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNGAP1Q96PV0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNGAP1Q96PV0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNGAP1Q96PV0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNGAP1Q96PV0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNGAP1Q96PV0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNGAP1Q96PV0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNGAP1Q96PV0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNGAP1Q96PV0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNGAP1Q96PV0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNGAP1Q96PV0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNGAP1Q96PV0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNGAP1Q96PV0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNGAP1Q96PV0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNGAP1Q96PV0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNGAP1Q96PV0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNGAP1Q96PV0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNGAP1Q96PV0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNGAP1Q96PV0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNGAP1Q96PV0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNGAP1Q96PV0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNGAP1Q96PV0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNGAP1Q96PV0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNGAP1Q96PV0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNGAP1Q96PV0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNGAP1Q96PV0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNGAP1Q96PV0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNGAP1Q96PV0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNGAP1Q96PV0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNGAP1Q96PV0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNGAP1Q96PV0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNGAP1Q96PV0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNGAP1Q96PV0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNGAP1Q96PV0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYNGAP1Q96PV0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYNGAP1Q96PV0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYNGAP1Q96PV0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SYNGAP1Q96PV0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SYNGAP1Q96PV0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SYNGAP1Q96PV0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SYNGAP1Q96PV0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
SYNGAP1Q96PV0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
SYNGAP1Q96PV0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNGAP1Q96PV0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNGAP1Q96PV0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNGAP1Q96PV0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNGAP1Q96PV0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNGAP1Q96PV0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNGAP1Q96PV0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNGAP1Q96PV0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNGAP1Q96PV0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNGAP1Q96PV0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNGAP1Q96PV0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNGAP1Q96PV0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNGAP1Q96PV0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNGAP1Q96PV0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNGAP1Q96PV0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNGAP1Q96PV0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNGAP1Q96PV0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNGAP1Q96PV0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNGAP1Q96PV0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNGAP1Q96PV0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNGAP1Q96PV0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNGAP1Q96PV0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNGAP1Q96PV0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNGAP1Q96PV0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNGAP1Q96PV0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNGAP1Q96PV0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNGAP1Q96PV0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNGAP1Q96PV0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNGAP1Q96PV0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms