Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC43Q96MW1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC43Q96MW1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC43Q96MW1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC43Q96MW1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC43Q96MW1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC43Q96MW1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC43Q96MW1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC43Q96MW1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC43Q96MW1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC43Q96MW1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC43Q96MW1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC43Q96MW1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC43Q96MW1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC43Q96MW1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC43Q96MW1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC43Q96MW1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC43Q96MW1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC43Q96MW1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC43Q96MW1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC43Q96MW1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC43Q96MW1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC43Q96MW1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC43Q96MW1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC43Q96MW1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC43Q96MW1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC43Q96MW1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC43Q96MW1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC43Q96MW1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC43Q96MW1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC43Q96MW1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC43Q96MW1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC43Q96MW1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC43Q96MW1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC43Q96MW1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC43Q96MW1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC43Q96MW1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC43Q96MW1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC43Q96MW1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC43Q96MW1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC43Q96MW1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC43Q96MW1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC43Q96MW1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC43Q96MW1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC43Q96MW1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC43Q96MW1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC43Q96MW1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC43Q96MW1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC43Q96MW1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC43Q96MW1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC43Q96MW1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC43Q96MW1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC43Q96MW1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC43Q96MW1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC43Q96MW1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC43Q96MW1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC43Q96MW1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC43Q96MW1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC43Q96MW1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC43Q96MW1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC43Q96MW1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC43Q96MW1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC43Q96MW1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC43Q96MW1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC43Q96MW1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC43Q96MW1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC43Q96MW1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC43Q96MW1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC43Q96MW1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC43Q96MW1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC43Q96MW1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC43Q96MW1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC43Q96MW1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC43Q96MW1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC43Q96MW1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC43Q96MW1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC43Q96MW1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC43Q96MW1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC43Q96MW1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC43Q96MW1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC43Q96MW1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC43Q96MW1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC43Q96MW1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC43Q96MW1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC43Q96MW1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC43Q96MW1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC43Q96MW1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC43Q96MW1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC43Q96MW1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC43Q96MW1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC43Q96MW1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC43Q96MW1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC43Q96MW1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC43Q96MW1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC43Q96MW1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC43Q96MW1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC43Q96MW1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC43Q96MW1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC43Q96MW1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC43Q96MW1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms