Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT6

C1orf74, UPF0739 protein C1orf74, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf74Q96LT6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf74Q96LT6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf74Q96LT6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf74Q96LT6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf74Q96LT6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf74Q96LT6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf74Q96LT6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf74Q96LT6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1orf74Q96LT6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1orf74Q96LT6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
C1orf74Q96LT6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1orf74Q96LT6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf74Q96LT6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf74Q96LT6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf74Q96LT6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf74Q96LT6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf74Q96LT6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf74Q96LT6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf74Q96LT6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf74Q96LT6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf74Q96LT6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf74Q96LT6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf74Q96LT6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf74Q96LT6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf74Q96LT6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf74Q96LT6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf74Q96LT6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf74Q96LT6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf74Q96LT6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf74Q96LT6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf74Q96LT6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf74Q96LT6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf74Q96LT6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf74Q96LT6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf74Q96LT6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf74Q96LT6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf74Q96LT6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1orf74Q96LT6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1orf74Q96LT6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1orf74Q96LT6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1orf74Q96LT6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1orf74Q96LT6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1orf74Q96LT6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
C1orf74Q96LT6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf74Q96LT6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1orf74Q96LT6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1orf74Q96LT6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms