Protein–RNA interactions for Protein: Q96LM1

LINC00615, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00615, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00615Q96LM1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00615Q96LM1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00615Q96LM1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00615Q96LM1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00615Q96LM1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00615Q96LM1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00615Q96LM1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00615Q96LM1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00615Q96LM1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00615Q96LM1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00615Q96LM1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00615Q96LM1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00615Q96LM1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00615Q96LM1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00615Q96LM1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00615Q96LM1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00615Q96LM1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00615Q96LM1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00615Q96LM1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00615Q96LM1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00615Q96LM1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LINC00615Q96LM1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LINC00615Q96LM1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LINC00615Q96LM1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LINC00615Q96LM1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC00615Q96LM1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC00615Q96LM1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC00615Q96LM1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00615Q96LM1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00615Q96LM1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00615Q96LM1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00615Q96LM1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00615Q96LM1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00615Q96LM1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00615Q96LM1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00615Q96LM1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00615Q96LM1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00615Q96LM1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00615Q96LM1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00615Q96LM1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00615Q96LM1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00615Q96LM1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00615Q96LM1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00615Q96LM1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00615Q96LM1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00615Q96LM1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00615Q96LM1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00615Q96LM1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00615Q96LM1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00615Q96LM1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00615Q96LM1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00615Q96LM1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00615Q96LM1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00615Q96LM1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00615Q96LM1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00615Q96LM1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00615Q96LM1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00615Q96LM1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00615Q96LM1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00615Q96LM1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00615Q96LM1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00615Q96LM1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00615Q96LM1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00615Q96LM1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00615Q96LM1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00615Q96LM1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00615Q96LM1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00615Q96LM1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00615Q96LM1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00615Q96LM1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00615Q96LM1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00615Q96LM1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00615Q96LM1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LINC00615Q96LM1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00615Q96LM1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00615Q96LM1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00615Q96LM1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00615Q96LM1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00615Q96LM1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00615Q96LM1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00615Q96LM1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00615Q96LM1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00615Q96LM1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00615Q96LM1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00615Q96LM1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00615Q96LM1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00615Q96LM1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00615Q96LM1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00615Q96LM1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00615Q96LM1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00615Q96LM1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00615Q96LM1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00615Q96LM1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00615Q96LM1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00615Q96LM1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00615Q96LM1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00615Q96LM1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00615Q96LM1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00615Q96LM1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00615Q96LM1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms