Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00208Q96KT6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms