Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC34Q96HJ3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC34Q96HJ3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC34Q96HJ3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC34Q96HJ3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC34Q96HJ3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC34Q96HJ3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC34Q96HJ3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC34Q96HJ3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC34Q96HJ3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC34Q96HJ3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC34Q96HJ3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC34Q96HJ3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC34Q96HJ3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC34Q96HJ3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC34Q96HJ3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC34Q96HJ3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC34Q96HJ3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC34Q96HJ3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC34Q96HJ3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC34Q96HJ3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC34Q96HJ3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC34Q96HJ3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC34Q96HJ3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC34Q96HJ3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC34Q96HJ3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC34Q96HJ3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC34Q96HJ3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC34Q96HJ3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC34Q96HJ3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC34Q96HJ3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC34Q96HJ3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC34Q96HJ3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC34Q96HJ3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC34Q96HJ3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC34Q96HJ3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC34Q96HJ3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC34Q96HJ3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC34Q96HJ3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC34Q96HJ3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC34Q96HJ3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC34Q96HJ3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC34Q96HJ3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC34Q96HJ3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC34Q96HJ3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC34Q96HJ3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC34Q96HJ3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC34Q96HJ3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC34Q96HJ3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC34Q96HJ3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC34Q96HJ3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC34Q96HJ3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC34Q96HJ3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC34Q96HJ3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC34Q96HJ3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC34Q96HJ3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC34Q96HJ3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC34Q96HJ3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC34Q96HJ3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC34Q96HJ3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC34Q96HJ3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC34Q96HJ3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC34Q96HJ3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC34Q96HJ3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC34Q96HJ3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC34Q96HJ3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC34Q96HJ3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC34Q96HJ3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CCDC34Q96HJ3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC34Q96HJ3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC34Q96HJ3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC34Q96HJ3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC34Q96HJ3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC34Q96HJ3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC34Q96HJ3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC34Q96HJ3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC34Q96HJ3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC34Q96HJ3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC34Q96HJ3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC34Q96HJ3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC34Q96HJ3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC34Q96HJ3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC34Q96HJ3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC34Q96HJ3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC34Q96HJ3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC34Q96HJ3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC34Q96HJ3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC34Q96HJ3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC34Q96HJ3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC34Q96HJ3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC34Q96HJ3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC34Q96HJ3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC34Q96HJ3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC34Q96HJ3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC34Q96HJ3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC34Q96HJ3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC34Q96HJ3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC34Q96HJ3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC34Q96HJ3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC34Q96HJ3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms