Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMIM12Q96EX1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM12Q96EX1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM12Q96EX1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM12Q96EX1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM12Q96EX1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM12Q96EX1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM12Q96EX1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM12Q96EX1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM12Q96EX1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM12Q96EX1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM12Q96EX1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM12Q96EX1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM12Q96EX1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM12Q96EX1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM12Q96EX1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM12Q96EX1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM12Q96EX1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM12Q96EX1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM12Q96EX1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM12Q96EX1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM12Q96EX1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM12Q96EX1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM12Q96EX1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM12Q96EX1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM12Q96EX1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM12Q96EX1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM12Q96EX1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM12Q96EX1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM12Q96EX1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM12Q96EX1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM12Q96EX1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM12Q96EX1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM12Q96EX1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM12Q96EX1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM12Q96EX1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM12Q96EX1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM12Q96EX1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM12Q96EX1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM12Q96EX1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM12Q96EX1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM12Q96EX1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM12Q96EX1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM12Q96EX1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM12Q96EX1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM12Q96EX1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM12Q96EX1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM12Q96EX1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms