Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GCC1Q96CN9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GCC1Q96CN9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GCC1Q96CN9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
GCC1Q96CN9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
GCC1Q96CN9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GCC1Q96CN9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GCC1Q96CN9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GCC1Q96CN9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GCC1Q96CN9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GCC1Q96CN9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GCC1Q96CN9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GCC1Q96CN9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GCC1Q96CN9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GCC1Q96CN9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GCC1Q96CN9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GCC1Q96CN9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GCC1Q96CN9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GCC1Q96CN9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GCC1Q96CN9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GCC1Q96CN9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GCC1Q96CN9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GCC1Q96CN9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GCC1Q96CN9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GCC1Q96CN9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GCC1Q96CN9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GCC1Q96CN9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GCC1Q96CN9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GCC1Q96CN9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GCC1Q96CN9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GCC1Q96CN9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GCC1Q96CN9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GCC1Q96CN9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GCC1Q96CN9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GCC1Q96CN9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GCC1Q96CN9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GCC1Q96CN9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GCC1Q96CN9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GCC1Q96CN9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
GCC1Q96CN9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GCC1Q96CN9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
GCC1Q96CN9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GCC1Q96CN9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GCC1Q96CN9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GCC1Q96CN9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GCC1Q96CN9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GCC1Q96CN9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GCC1Q96CN9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
GCC1Q96CN9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GCC1Q96CN9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GCC1Q96CN9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GCC1Q96CN9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GCC1Q96CN9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GCC1Q96CN9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GCC1Q96CN9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GCC1Q96CN9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
GCC1Q96CN9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GCC1Q96CN9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GCC1Q96CN9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GCC1Q96CN9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GCC1Q96CN9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GCC1Q96CN9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GCC1Q96CN9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GCC1Q96CN9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GCC1Q96CN9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GCC1Q96CN9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GCC1Q96CN9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GCC1Q96CN9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GCC1Q96CN9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
GCC1Q96CN9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GCC1Q96CN9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GCC1Q96CN9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GCC1Q96CN9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GCC1Q96CN9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GCC1Q96CN9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GCC1Q96CN9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GCC1Q96CN9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GCC1Q96CN9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
GCC1Q96CN9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GCC1Q96CN9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GCC1Q96CN9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GCC1Q96CN9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
GCC1Q96CN9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GCC1Q96CN9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GCC1Q96CN9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GCC1Q96CN9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GCC1Q96CN9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GCC1Q96CN9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GCC1Q96CN9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GCC1Q96CN9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
GCC1Q96CN9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GCC1Q96CN9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GCC1Q96CN9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GCC1Q96CN9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GCC1Q96CN9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GCC1Q96CN9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GCC1Q96CN9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GCC1Q96CN9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GCC1Q96CN9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GCC1Q96CN9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms