Protein–RNA interactions for Protein: Q96BA8

CREB3L1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L1Q96BA8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L1Q96BA8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3L1Q96BA8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3L1Q96BA8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3L1Q96BA8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3L1Q96BA8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3L1Q96BA8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB3L1Q96BA8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB3L1Q96BA8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB3L1Q96BA8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB3L1Q96BA8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB3L1Q96BA8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB3L1Q96BA8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB3L1Q96BA8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB3L1Q96BA8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB3L1Q96BA8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB3L1Q96BA8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB3L1Q96BA8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB3L1Q96BA8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB3L1Q96BA8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB3L1Q96BA8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB3L1Q96BA8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB3L1Q96BA8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB3L1Q96BA8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB3L1Q96BA8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB3L1Q96BA8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB3L1Q96BA8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB3L1Q96BA8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB3L1Q96BA8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB3L1Q96BA8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB3L1Q96BA8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB3L1Q96BA8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB3L1Q96BA8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB3L1Q96BA8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB3L1Q96BA8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB3L1Q96BA8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB3L1Q96BA8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB3L1Q96BA8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB3L1Q96BA8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB3L1Q96BA8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB3L1Q96BA8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms