Protein–RNA interactions for Protein: Q96A83

COL26A1, Collagen alpha-1(XXVI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL26A1Q96A83 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL26A1Q96A83 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL26A1Q96A83 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL26A1Q96A83 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL26A1Q96A83 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
COL26A1Q96A83 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL26A1Q96A83 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL26A1Q96A83 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL26A1Q96A83 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL26A1Q96A83 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL26A1Q96A83 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL26A1Q96A83 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL26A1Q96A83 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL26A1Q96A83 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL26A1Q96A83 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL26A1Q96A83 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COL26A1Q96A83 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
COL26A1Q96A83 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL26A1Q96A83 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL26A1Q96A83 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL26A1Q96A83 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL26A1Q96A83 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL26A1Q96A83 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL26A1Q96A83 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL26A1Q96A83 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL26A1Q96A83 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL26A1Q96A83 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
COL26A1Q96A83 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL26A1Q96A83 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL26A1Q96A83 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL26A1Q96A83 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL26A1Q96A83 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL26A1Q96A83 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL26A1Q96A83 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL26A1Q96A83 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL26A1Q96A83 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL26A1Q96A83 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL26A1Q96A83 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL26A1Q96A83 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL26A1Q96A83 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL26A1Q96A83 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL26A1Q96A83 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL26A1Q96A83 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL26A1Q96A83 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL26A1Q96A83 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL26A1Q96A83 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL26A1Q96A83 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL26A1Q96A83 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms