Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHY2

RFWD2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, humanhuman

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD2Q8NHY2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFWD2Q8NHY2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFWD2Q8NHY2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFWD2Q8NHY2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFWD2Q8NHY2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFWD2Q8NHY2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFWD2Q8NHY2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFWD2Q8NHY2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFWD2Q8NHY2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFWD2Q8NHY2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFWD2Q8NHY2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFWD2Q8NHY2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RFWD2Q8NHY2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFWD2Q8NHY2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFWD2Q8NHY2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFWD2Q8NHY2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFWD2Q8NHY2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFWD2Q8NHY2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFWD2Q8NHY2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFWD2Q8NHY2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFWD2Q8NHY2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFWD2Q8NHY2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFWD2Q8NHY2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFWD2Q8NHY2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFWD2Q8NHY2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFWD2Q8NHY2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFWD2Q8NHY2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFWD2Q8NHY2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFWD2Q8NHY2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFWD2Q8NHY2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFWD2Q8NHY2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFWD2Q8NHY2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFWD2Q8NHY2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFWD2Q8NHY2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFWD2Q8NHY2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFWD2Q8NHY2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFWD2Q8NHY2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RFWD2Q8NHY2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFWD2Q8NHY2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFWD2Q8NHY2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFWD2Q8NHY2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFWD2Q8NHY2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFWD2Q8NHY2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFWD2Q8NHY2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFWD2Q8NHY2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFWD2Q8NHY2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFWD2Q8NHY2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFWD2Q8NHY2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFWD2Q8NHY2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFWD2Q8NHY2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RFWD2Q8NHY2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFWD2Q8NHY2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFWD2Q8NHY2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFWD2Q8NHY2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFWD2Q8NHY2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFWD2Q8NHY2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFWD2Q8NHY2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFWD2Q8NHY2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFWD2Q8NHY2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFWD2Q8NHY2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RFWD2Q8NHY2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RFWD2Q8NHY2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFWD2Q8NHY2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RFWD2Q8NHY2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFWD2Q8NHY2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms