Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LINC00301Q8NCQ3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LINC00301Q8NCQ3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
LINC00301Q8NCQ3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LINC00301Q8NCQ3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LINC00301Q8NCQ3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LINC00301Q8NCQ3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LINC00301Q8NCQ3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LINC00301Q8NCQ3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LINC00301Q8NCQ3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LINC00301Q8NCQ3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LINC00301Q8NCQ3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LINC00301Q8NCQ3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LINC00301Q8NCQ3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LINC00301Q8NCQ3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
LINC00301Q8NCQ3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LINC00301Q8NCQ3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LINC00301Q8NCQ3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LINC00301Q8NCQ3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LINC00301Q8NCQ3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LINC00301Q8NCQ3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LINC00301Q8NCQ3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LINC00301Q8NCQ3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LINC00301Q8NCQ3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LINC00301Q8NCQ3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LINC00301Q8NCQ3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LINC00301Q8NCQ3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LINC00301Q8NCQ3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LINC00301Q8NCQ3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LINC00301Q8NCQ3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LINC00301Q8NCQ3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LINC00301Q8NCQ3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LINC00301Q8NCQ3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LINC00301Q8NCQ3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LINC00301Q8NCQ3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LINC00301Q8NCQ3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LINC00301Q8NCQ3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LINC00301Q8NCQ3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LINC00301Q8NCQ3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LINC00301Q8NCQ3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LINC00301Q8NCQ3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LINC00301Q8NCQ3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LINC00301Q8NCQ3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LINC00301Q8NCQ3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LINC00301Q8NCQ3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LINC00301Q8NCQ3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LINC00301Q8NCQ3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LINC00301Q8NCQ3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LINC00301Q8NCQ3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LINC00301Q8NCQ3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LINC00301Q8NCQ3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LINC00301Q8NCQ3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LINC00301Q8NCQ3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LINC00301Q8NCQ3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LINC00301Q8NCQ3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LINC00301Q8NCQ3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LINC00301Q8NCQ3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LINC00301Q8NCQ3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LINC00301Q8NCQ3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LINC00301Q8NCQ3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LINC00301Q8NCQ3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LINC00301Q8NCQ3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LINC00301Q8NCQ3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LINC00301Q8NCQ3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LINC00301Q8NCQ3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LINC00301Q8NCQ3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LINC00301Q8NCQ3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LINC00301Q8NCQ3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LINC00301Q8NCQ3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LINC00301Q8NCQ3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LINC00301Q8NCQ3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LINC00301Q8NCQ3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LINC00301Q8NCQ3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LINC00301Q8NCQ3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LINC00301Q8NCQ3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LINC00301Q8NCQ3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LINC00301Q8NCQ3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LINC00301Q8NCQ3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LINC00301Q8NCQ3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LINC00301Q8NCQ3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LINC00301Q8NCQ3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LINC00301Q8NCQ3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LINC00301Q8NCQ3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LINC00301Q8NCQ3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LINC00301Q8NCQ3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LINC00301Q8NCQ3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LINC00301Q8NCQ3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LINC00301Q8NCQ3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LINC00301Q8NCQ3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LINC00301Q8NCQ3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LINC00301Q8NCQ3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LINC00301Q8NCQ3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LINC00301Q8NCQ3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LINC00301Q8NCQ3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LINC00301Q8NCQ3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LINC00301Q8NCQ3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LINC00301Q8NCQ3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LINC00301Q8NCQ3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LINC00301Q8NCQ3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LINC00301Q8NCQ3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms