Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9S9

SNX31, Sorting nexin-31, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX31Q8N9S9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX31Q8N9S9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX31Q8N9S9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX31Q8N9S9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX31Q8N9S9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX31Q8N9S9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX31Q8N9S9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX31Q8N9S9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX31Q8N9S9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX31Q8N9S9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX31Q8N9S9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX31Q8N9S9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX31Q8N9S9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX31Q8N9S9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX31Q8N9S9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX31Q8N9S9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX31Q8N9S9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX31Q8N9S9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX31Q8N9S9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX31Q8N9S9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX31Q8N9S9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX31Q8N9S9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX31Q8N9S9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX31Q8N9S9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX31Q8N9S9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX31Q8N9S9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX31Q8N9S9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX31Q8N9S9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX31Q8N9S9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX31Q8N9S9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX31Q8N9S9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX31Q8N9S9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX31Q8N9S9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX31Q8N9S9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX31Q8N9S9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX31Q8N9S9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX31Q8N9S9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX31Q8N9S9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX31Q8N9S9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX31Q8N9S9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX31Q8N9S9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX31Q8N9S9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX31Q8N9S9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX31Q8N9S9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX31Q8N9S9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX31Q8N9S9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNX31Q8N9S9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNX31Q8N9S9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX31Q8N9S9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX31Q8N9S9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX31Q8N9S9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX31Q8N9S9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX31Q8N9S9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX31Q8N9S9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX31Q8N9S9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX31Q8N9S9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX31Q8N9S9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX31Q8N9S9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX31Q8N9S9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX31Q8N9S9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX31Q8N9S9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX31Q8N9S9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX31Q8N9S9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX31Q8N9S9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX31Q8N9S9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX31Q8N9S9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX31Q8N9S9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX31Q8N9S9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX31Q8N9S9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX31Q8N9S9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX31Q8N9S9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX31Q8N9S9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX31Q8N9S9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX31Q8N9S9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX31Q8N9S9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX31Q8N9S9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX31Q8N9S9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX31Q8N9S9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX31Q8N9S9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX31Q8N9S9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX31Q8N9S9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX31Q8N9S9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX31Q8N9S9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX31Q8N9S9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX31Q8N9S9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX31Q8N9S9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX31Q8N9S9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX31Q8N9S9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX31Q8N9S9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms