Protein–RNA interactions for Protein: Q8N999

C12orf29, Uncharacterized protein C12orf29, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf29Q8N999 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
C12orf29Q8N999 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C12orf29Q8N999 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
C12orf29Q8N999 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
C12orf29Q8N999 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C12orf29Q8N999 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C12orf29Q8N999 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C12orf29Q8N999 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C12orf29Q8N999 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C12orf29Q8N999 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C12orf29Q8N999 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C12orf29Q8N999 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C12orf29Q8N999 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C12orf29Q8N999 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C12orf29Q8N999 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C12orf29Q8N999 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C12orf29Q8N999 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C12orf29Q8N999 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C12orf29Q8N999 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C12orf29Q8N999 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C12orf29Q8N999 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C12orf29Q8N999 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C12orf29Q8N999 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
C12orf29Q8N999 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C12orf29Q8N999 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C12orf29Q8N999 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C12orf29Q8N999 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C12orf29Q8N999 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C12orf29Q8N999 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C12orf29Q8N999 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C12orf29Q8N999 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C12orf29Q8N999 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C12orf29Q8N999 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C12orf29Q8N999 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C12orf29Q8N999 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C12orf29Q8N999 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C12orf29Q8N999 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C12orf29Q8N999 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
C12orf29Q8N999 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C12orf29Q8N999 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C12orf29Q8N999 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C12orf29Q8N999 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
C12orf29Q8N999 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
C12orf29Q8N999 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
C12orf29Q8N999 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C12orf29Q8N999 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C12orf29Q8N999 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
C12orf29Q8N999 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C12orf29Q8N999 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C12orf29Q8N999 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
C12orf29Q8N999 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C12orf29Q8N999 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C12orf29Q8N999 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C12orf29Q8N999 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C12orf29Q8N999 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C12orf29Q8N999 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C12orf29Q8N999 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
C12orf29Q8N999 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C12orf29Q8N999 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C12orf29Q8N999 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C12orf29Q8N999 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C12orf29Q8N999 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C12orf29Q8N999 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C12orf29Q8N999 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C12orf29Q8N999 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C12orf29Q8N999 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C12orf29Q8N999 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C12orf29Q8N999 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C12orf29Q8N999 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C12orf29Q8N999 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C12orf29Q8N999 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C12orf29Q8N999 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C12orf29Q8N999 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C12orf29Q8N999 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C12orf29Q8N999 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C12orf29Q8N999 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C12orf29Q8N999 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C12orf29Q8N999 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C12orf29Q8N999 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C12orf29Q8N999 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C12orf29Q8N999 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C12orf29Q8N999 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C12orf29Q8N999 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C12orf29Q8N999 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C12orf29Q8N999 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C12orf29Q8N999 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C12orf29Q8N999 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C12orf29Q8N999 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C12orf29Q8N999 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C12orf29Q8N999 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C12orf29Q8N999 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C12orf29Q8N999 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C12orf29Q8N999 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C12orf29Q8N999 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C12orf29Q8N999 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C12orf29Q8N999 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C12orf29Q8N999 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C12orf29Q8N999 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C12orf29Q8N999 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C12orf29Q8N999 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms