Protein–RNA interactions for Protein: Q8N987

NECAB1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAB1Q8N987 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NECAB1Q8N987 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NECAB1Q8N987 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NECAB1Q8N987 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NECAB1Q8N987 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NECAB1Q8N987 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NECAB1Q8N987 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NECAB1Q8N987 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NECAB1Q8N987 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NECAB1Q8N987 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NECAB1Q8N987 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NECAB1Q8N987 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NECAB1Q8N987 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NECAB1Q8N987 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NECAB1Q8N987 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NECAB1Q8N987 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NECAB1Q8N987 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NECAB1Q8N987 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NECAB1Q8N987 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NECAB1Q8N987 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NECAB1Q8N987 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NECAB1Q8N987 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NECAB1Q8N987 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NECAB1Q8N987 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NECAB1Q8N987 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NECAB1Q8N987 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NECAB1Q8N987 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NECAB1Q8N987 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NECAB1Q8N987 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NECAB1Q8N987 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NECAB1Q8N987 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NECAB1Q8N987 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NECAB1Q8N987 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NECAB1Q8N987 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NECAB1Q8N987 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NECAB1Q8N987 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NECAB1Q8N987 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NECAB1Q8N987 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NECAB1Q8N987 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NECAB1Q8N987 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NECAB1Q8N987 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NECAB1Q8N987 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NECAB1Q8N987 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NECAB1Q8N987 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NECAB1Q8N987 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NECAB1Q8N987 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NECAB1Q8N987 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NECAB1Q8N987 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NECAB1Q8N987 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NECAB1Q8N987 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NECAB1Q8N987 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NECAB1Q8N987 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NECAB1Q8N987 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NECAB1Q8N987 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NECAB1Q8N987 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NECAB1Q8N987 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NECAB1Q8N987 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NECAB1Q8N987 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NECAB1Q8N987 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NECAB1Q8N987 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NECAB1Q8N987 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NECAB1Q8N987 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NECAB1Q8N987 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NECAB1Q8N987 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NECAB1Q8N987 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NECAB1Q8N987 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NECAB1Q8N987 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NECAB1Q8N987 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NECAB1Q8N987 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NECAB1Q8N987 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NECAB1Q8N987 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NECAB1Q8N987 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NECAB1Q8N987 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NECAB1Q8N987 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NECAB1Q8N987 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NECAB1Q8N987 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NECAB1Q8N987 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NECAB1Q8N987 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NECAB1Q8N987 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NECAB1Q8N987 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NECAB1Q8N987 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NECAB1Q8N987 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NECAB1Q8N987 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NECAB1Q8N987 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NECAB1Q8N987 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NECAB1Q8N987 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NECAB1Q8N987 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NECAB1Q8N987 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NECAB1Q8N987 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NECAB1Q8N987 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NECAB1Q8N987 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NECAB1Q8N987 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NECAB1Q8N987 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NECAB1Q8N987 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NECAB1Q8N987 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NECAB1Q8N987 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
NECAB1Q8N987 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
NECAB1Q8N987 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NECAB1Q8N987 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NECAB1Q8N987 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.1 ms