Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MSL3Q8N5Y2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MSL3Q8N5Y2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MSL3Q8N5Y2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MSL3Q8N5Y2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MSL3Q8N5Y2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MSL3Q8N5Y2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MSL3Q8N5Y2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MSL3Q8N5Y2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MSL3Q8N5Y2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MSL3Q8N5Y2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MSL3Q8N5Y2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MSL3Q8N5Y2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MSL3Q8N5Y2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MSL3Q8N5Y2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MSL3Q8N5Y2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MSL3Q8N5Y2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MSL3Q8N5Y2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MSL3Q8N5Y2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MSL3Q8N5Y2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MSL3Q8N5Y2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MSL3Q8N5Y2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MSL3Q8N5Y2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MSL3Q8N5Y2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MSL3Q8N5Y2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MSL3Q8N5Y2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MSL3Q8N5Y2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MSL3Q8N5Y2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MSL3Q8N5Y2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MSL3Q8N5Y2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MSL3Q8N5Y2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MSL3Q8N5Y2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MSL3Q8N5Y2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MSL3Q8N5Y2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MSL3Q8N5Y2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MSL3Q8N5Y2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MSL3Q8N5Y2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MSL3Q8N5Y2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MSL3Q8N5Y2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MSL3Q8N5Y2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MSL3Q8N5Y2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MSL3Q8N5Y2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MSL3Q8N5Y2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MSL3Q8N5Y2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MSL3Q8N5Y2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MSL3Q8N5Y2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MSL3Q8N5Y2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MSL3Q8N5Y2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MSL3Q8N5Y2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MSL3Q8N5Y2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MSL3Q8N5Y2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MSL3Q8N5Y2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MSL3Q8N5Y2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MSL3Q8N5Y2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MSL3Q8N5Y2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MSL3Q8N5Y2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MSL3Q8N5Y2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MSL3Q8N5Y2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MSL3Q8N5Y2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MSL3Q8N5Y2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MSL3Q8N5Y2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MSL3Q8N5Y2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MSL3Q8N5Y2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MSL3Q8N5Y2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MSL3Q8N5Y2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MSL3Q8N5Y2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MSL3Q8N5Y2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MSL3Q8N5Y2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MSL3Q8N5Y2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MSL3Q8N5Y2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MSL3Q8N5Y2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MSL3Q8N5Y2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MSL3Q8N5Y2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MSL3Q8N5Y2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MSL3Q8N5Y2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MSL3Q8N5Y2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MSL3Q8N5Y2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MSL3Q8N5Y2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MSL3Q8N5Y2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MSL3Q8N5Y2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
MSL3Q8N5Y2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
MSL3Q8N5Y2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MSL3Q8N5Y2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MSL3Q8N5Y2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MSL3Q8N5Y2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MSL3Q8N5Y2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MSL3Q8N5Y2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MSL3Q8N5Y2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MSL3Q8N5Y2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
MSL3Q8N5Y2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MSL3Q8N5Y2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
MSL3Q8N5Y2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
MSL3Q8N5Y2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
MSL3Q8N5Y2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
MSL3Q8N5Y2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MSL3Q8N5Y2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MSL3Q8N5Y2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MSL3Q8N5Y2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MSL3Q8N5Y2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
MSL3Q8N5Y2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms