Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWQ3

BRSK2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK2Q8IWQ3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms