Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU7

SCX, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCXQ7RTU7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCXQ7RTU7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCXQ7RTU7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms