Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H2AFVQ71UI9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H2AFVQ71UI9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H2AFVQ71UI9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H2AFVQ71UI9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H2AFVQ71UI9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
H2AFVQ71UI9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
H2AFVQ71UI9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
H2AFVQ71UI9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
H2AFVQ71UI9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
H2AFVQ71UI9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
H2AFVQ71UI9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H2AFVQ71UI9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H2AFVQ71UI9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H2AFVQ71UI9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
H2AFVQ71UI9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H2AFVQ71UI9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
H2AFVQ71UI9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
H2AFVQ71UI9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H2AFVQ71UI9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H2AFVQ71UI9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
H2AFVQ71UI9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H2AFVQ71UI9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
H2AFVQ71UI9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
H2AFVQ71UI9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
H2AFVQ71UI9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
H2AFVQ71UI9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
H2AFVQ71UI9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
H2AFVQ71UI9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
H2AFVQ71UI9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
H2AFVQ71UI9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
H2AFVQ71UI9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
H2AFVQ71UI9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
H2AFVQ71UI9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
H2AFVQ71UI9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
H2AFVQ71UI9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
H2AFVQ71UI9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
H2AFVQ71UI9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
H2AFVQ71UI9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
H2AFVQ71UI9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
H2AFVQ71UI9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
H2AFVQ71UI9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
H2AFVQ71UI9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
H2AFVQ71UI9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
H2AFVQ71UI9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
H2AFVQ71UI9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
H2AFVQ71UI9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
H2AFVQ71UI9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
H2AFVQ71UI9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
H2AFVQ71UI9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
H2AFVQ71UI9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
H2AFVQ71UI9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
H2AFVQ71UI9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
H2AFVQ71UI9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
H2AFVQ71UI9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
H2AFVQ71UI9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
H2AFVQ71UI9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
H2AFVQ71UI9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
H2AFVQ71UI9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
H2AFVQ71UI9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
H2AFVQ71UI9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
H2AFVQ71UI9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
H2AFVQ71UI9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
H2AFVQ71UI9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
H2AFVQ71UI9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
H2AFVQ71UI9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
H2AFVQ71UI9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
H2AFVQ71UI9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
H2AFVQ71UI9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
H2AFVQ71UI9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
H2AFVQ71UI9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
H2AFVQ71UI9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
H2AFVQ71UI9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
H2AFVQ71UI9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
H2AFVQ71UI9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
H2AFVQ71UI9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
H2AFVQ71UI9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
H2AFVQ71UI9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
H2AFVQ71UI9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
H2AFVQ71UI9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
H2AFVQ71UI9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
H2AFVQ71UI9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
H2AFVQ71UI9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
H2AFVQ71UI9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
H2AFVQ71UI9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
H2AFVQ71UI9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
H2AFVQ71UI9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25■■□□□ 1.59
H2AFVQ71UI9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
H2AFVQ71UI9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
H2AFVQ71UI9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
H2AFVQ71UI9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
H2AFVQ71UI9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
H2AFVQ71UI9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
H2AFVQ71UI9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H2AFVQ71UI9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H2AFVQ71UI9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
H2AFVQ71UI9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
H2AFVQ71UI9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H2AFVQ71UI9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
H2AFVQ71UI9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms