Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSG1

RNF165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF165Q6ZSG1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF165Q6ZSG1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF165Q6ZSG1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF165Q6ZSG1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF165Q6ZSG1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF165Q6ZSG1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF165Q6ZSG1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF165Q6ZSG1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF165Q6ZSG1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF165Q6ZSG1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF165Q6ZSG1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF165Q6ZSG1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF165Q6ZSG1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF165Q6ZSG1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF165Q6ZSG1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF165Q6ZSG1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF165Q6ZSG1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF165Q6ZSG1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF165Q6ZSG1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF165Q6ZSG1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF165Q6ZSG1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF165Q6ZSG1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF165Q6ZSG1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF165Q6ZSG1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF165Q6ZSG1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF165Q6ZSG1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF165Q6ZSG1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF165Q6ZSG1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF165Q6ZSG1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF165Q6ZSG1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF165Q6ZSG1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF165Q6ZSG1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF165Q6ZSG1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF165Q6ZSG1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF165Q6ZSG1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF165Q6ZSG1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF165Q6ZSG1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF165Q6ZSG1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF165Q6ZSG1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF165Q6ZSG1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF165Q6ZSG1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF165Q6ZSG1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF165Q6ZSG1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF165Q6ZSG1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RNF165Q6ZSG1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RNF165Q6ZSG1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF165Q6ZSG1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF165Q6ZSG1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF165Q6ZSG1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF165Q6ZSG1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF165Q6ZSG1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF165Q6ZSG1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF165Q6ZSG1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF165Q6ZSG1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF165Q6ZSG1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF165Q6ZSG1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF165Q6ZSG1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF165Q6ZSG1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF165Q6ZSG1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF165Q6ZSG1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF165Q6ZSG1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF165Q6ZSG1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF165Q6ZSG1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF165Q6ZSG1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF165Q6ZSG1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF165Q6ZSG1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF165Q6ZSG1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF165Q6ZSG1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF165Q6ZSG1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF165Q6ZSG1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF165Q6ZSG1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF165Q6ZSG1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF165Q6ZSG1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF165Q6ZSG1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF165Q6ZSG1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF165Q6ZSG1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF165Q6ZSG1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF165Q6ZSG1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF165Q6ZSG1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF165Q6ZSG1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF165Q6ZSG1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF165Q6ZSG1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF165Q6ZSG1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF165Q6ZSG1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF165Q6ZSG1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF165Q6ZSG1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF165Q6ZSG1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF165Q6ZSG1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF165Q6ZSG1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF165Q6ZSG1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF165Q6ZSG1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms