Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFWD3Q6PCD5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFWD3Q6PCD5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFWD3Q6PCD5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RFWD3Q6PCD5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFWD3Q6PCD5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFWD3Q6PCD5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFWD3Q6PCD5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFWD3Q6PCD5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFWD3Q6PCD5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFWD3Q6PCD5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFWD3Q6PCD5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFWD3Q6PCD5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RFWD3Q6PCD5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFWD3Q6PCD5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFWD3Q6PCD5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RFWD3Q6PCD5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFWD3Q6PCD5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFWD3Q6PCD5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFWD3Q6PCD5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFWD3Q6PCD5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFWD3Q6PCD5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFWD3Q6PCD5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFWD3Q6PCD5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFWD3Q6PCD5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFWD3Q6PCD5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFWD3Q6PCD5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFWD3Q6PCD5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFWD3Q6PCD5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFWD3Q6PCD5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFWD3Q6PCD5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFWD3Q6PCD5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFWD3Q6PCD5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFWD3Q6PCD5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFWD3Q6PCD5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFWD3Q6PCD5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFWD3Q6PCD5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFWD3Q6PCD5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFWD3Q6PCD5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RFWD3Q6PCD5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFWD3Q6PCD5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFWD3Q6PCD5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFWD3Q6PCD5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFWD3Q6PCD5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFWD3Q6PCD5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFWD3Q6PCD5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFWD3Q6PCD5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFWD3Q6PCD5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFWD3Q6PCD5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFWD3Q6PCD5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFWD3Q6PCD5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFWD3Q6PCD5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFWD3Q6PCD5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFWD3Q6PCD5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFWD3Q6PCD5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFWD3Q6PCD5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFWD3Q6PCD5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFWD3Q6PCD5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFWD3Q6PCD5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFWD3Q6PCD5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFWD3Q6PCD5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFWD3Q6PCD5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFWD3Q6PCD5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RFWD3Q6PCD5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFWD3Q6PCD5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFWD3Q6PCD5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RFWD3Q6PCD5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFWD3Q6PCD5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFWD3Q6PCD5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFWD3Q6PCD5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFWD3Q6PCD5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFWD3Q6PCD5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFWD3Q6PCD5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFWD3Q6PCD5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFWD3Q6PCD5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFWD3Q6PCD5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFWD3Q6PCD5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFWD3Q6PCD5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFWD3Q6PCD5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RFWD3Q6PCD5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RFWD3Q6PCD5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RFWD3Q6PCD5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFWD3Q6PCD5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFWD3Q6PCD5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFWD3Q6PCD5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFWD3Q6PCD5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFWD3Q6PCD5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFWD3Q6PCD5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFWD3Q6PCD5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFWD3Q6PCD5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RFWD3Q6PCD5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFWD3Q6PCD5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFWD3Q6PCD5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFWD3Q6PCD5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFWD3Q6PCD5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RFWD3Q6PCD5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
RFWD3Q6PCD5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RFWD3Q6PCD5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RFWD3Q6PCD5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RFWD3Q6PCD5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.5 ms