Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAVIN1Q6NZI2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CAVIN1Q6NZI2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAVIN1Q6NZI2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CAVIN1Q6NZI2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAVIN1Q6NZI2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAVIN1Q6NZI2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAVIN1Q6NZI2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAVIN1Q6NZI2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAVIN1Q6NZI2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAVIN1Q6NZI2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAVIN1Q6NZI2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAVIN1Q6NZI2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAVIN1Q6NZI2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAVIN1Q6NZI2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAVIN1Q6NZI2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAVIN1Q6NZI2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAVIN1Q6NZI2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAVIN1Q6NZI2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAVIN1Q6NZI2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAVIN1Q6NZI2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAVIN1Q6NZI2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAVIN1Q6NZI2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAVIN1Q6NZI2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAVIN1Q6NZI2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAVIN1Q6NZI2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAVIN1Q6NZI2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAVIN1Q6NZI2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAVIN1Q6NZI2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAVIN1Q6NZI2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAVIN1Q6NZI2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CAVIN1Q6NZI2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAVIN1Q6NZI2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAVIN1Q6NZI2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAVIN1Q6NZI2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAVIN1Q6NZI2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CAVIN1Q6NZI2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CAVIN1Q6NZI2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CAVIN1Q6NZI2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CAVIN1Q6NZI2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CAVIN1Q6NZI2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CAVIN1Q6NZI2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CAVIN1Q6NZI2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAVIN1Q6NZI2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAVIN1Q6NZI2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAVIN1Q6NZI2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAVIN1Q6NZI2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAVIN1Q6NZI2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAVIN1Q6NZI2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAVIN1Q6NZI2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAVIN1Q6NZI2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAVIN1Q6NZI2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAVIN1Q6NZI2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAVIN1Q6NZI2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAVIN1Q6NZI2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAVIN1Q6NZI2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAVIN1Q6NZI2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAVIN1Q6NZI2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAVIN1Q6NZI2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CAVIN1Q6NZI2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAVIN1Q6NZI2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAVIN1Q6NZI2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAVIN1Q6NZI2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CAVIN1Q6NZI2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAVIN1Q6NZI2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAVIN1Q6NZI2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAVIN1Q6NZI2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAVIN1Q6NZI2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAVIN1Q6NZI2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CAVIN1Q6NZI2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAVIN1Q6NZI2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAVIN1Q6NZI2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAVIN1Q6NZI2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CAVIN1Q6NZI2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CAVIN1Q6NZI2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CAVIN1Q6NZI2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CAVIN1Q6NZI2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CAVIN1Q6NZI2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CAVIN1Q6NZI2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CAVIN1Q6NZI2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAVIN1Q6NZI2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAVIN1Q6NZI2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAVIN1Q6NZI2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAVIN1Q6NZI2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAVIN1Q6NZI2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAVIN1Q6NZI2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAVIN1Q6NZI2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CAVIN1Q6NZI2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAVIN1Q6NZI2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAVIN1Q6NZI2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAVIN1Q6NZI2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAVIN1Q6NZI2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAVIN1Q6NZI2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAVIN1Q6NZI2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAVIN1Q6NZI2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAVIN1Q6NZI2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAVIN1Q6NZI2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAVIN1Q6NZI2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAVIN1Q6NZI2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAVIN1Q6NZI2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms