Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
E4F1Q66K89 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
E4F1Q66K89 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
E4F1Q66K89 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
E4F1Q66K89 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
E4F1Q66K89 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
E4F1Q66K89 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
E4F1Q66K89 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
E4F1Q66K89 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
E4F1Q66K89 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
E4F1Q66K89 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
E4F1Q66K89 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
E4F1Q66K89 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
E4F1Q66K89 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
E4F1Q66K89 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
E4F1Q66K89 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
E4F1Q66K89 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
E4F1Q66K89 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
E4F1Q66K89 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
E4F1Q66K89 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
E4F1Q66K89 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
E4F1Q66K89 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
E4F1Q66K89 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
E4F1Q66K89 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
E4F1Q66K89 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
E4F1Q66K89 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
E4F1Q66K89 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
E4F1Q66K89 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
E4F1Q66K89 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
E4F1Q66K89 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
E4F1Q66K89 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
E4F1Q66K89 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
E4F1Q66K89 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
E4F1Q66K89 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
E4F1Q66K89 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
E4F1Q66K89 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
E4F1Q66K89 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
E4F1Q66K89 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
E4F1Q66K89 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
E4F1Q66K89 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
E4F1Q66K89 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
E4F1Q66K89 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
E4F1Q66K89 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
E4F1Q66K89 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
E4F1Q66K89 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
E4F1Q66K89 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
E4F1Q66K89 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
E4F1Q66K89 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
E4F1Q66K89 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
E4F1Q66K89 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
E4F1Q66K89 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
E4F1Q66K89 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
E4F1Q66K89 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
E4F1Q66K89 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
E4F1Q66K89 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
E4F1Q66K89 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
E4F1Q66K89 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
E4F1Q66K89 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
E4F1Q66K89 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
E4F1Q66K89 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
E4F1Q66K89 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
E4F1Q66K89 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
E4F1Q66K89 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
E4F1Q66K89 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
E4F1Q66K89 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
E4F1Q66K89 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
E4F1Q66K89 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
E4F1Q66K89 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
E4F1Q66K89 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
E4F1Q66K89 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
E4F1Q66K89 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
E4F1Q66K89 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
E4F1Q66K89 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
E4F1Q66K89 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
E4F1Q66K89 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
E4F1Q66K89 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
E4F1Q66K89 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
E4F1Q66K89 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
E4F1Q66K89 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
E4F1Q66K89 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
E4F1Q66K89 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
E4F1Q66K89 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
E4F1Q66K89 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
E4F1Q66K89 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
E4F1Q66K89 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms