Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms