Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD1

TIMM23B, Putative mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim23B, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM23BQ5SRD1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TIMM23BQ5SRD1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TIMM23BQ5SRD1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TIMM23BQ5SRD1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TIMM23BQ5SRD1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TIMM23BQ5SRD1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TIMM23BQ5SRD1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TIMM23BQ5SRD1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TIMM23BQ5SRD1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TIMM23BQ5SRD1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TIMM23BQ5SRD1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TIMM23BQ5SRD1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TIMM23BQ5SRD1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TIMM23BQ5SRD1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TIMM23BQ5SRD1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TIMM23BQ5SRD1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TIMM23BQ5SRD1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TIMM23BQ5SRD1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TIMM23BQ5SRD1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TIMM23BQ5SRD1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TIMM23BQ5SRD1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TIMM23BQ5SRD1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TIMM23BQ5SRD1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TIMM23BQ5SRD1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TIMM23BQ5SRD1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TIMM23BQ5SRD1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TIMM23BQ5SRD1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TIMM23BQ5SRD1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TIMM23BQ5SRD1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TIMM23BQ5SRD1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIMM23BQ5SRD1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIMM23BQ5SRD1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TIMM23BQ5SRD1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIMM23BQ5SRD1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIMM23BQ5SRD1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIMM23BQ5SRD1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIMM23BQ5SRD1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIMM23BQ5SRD1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIMM23BQ5SRD1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIMM23BQ5SRD1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TIMM23BQ5SRD1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TIMM23BQ5SRD1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TIMM23BQ5SRD1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TIMM23BQ5SRD1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TIMM23BQ5SRD1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TIMM23BQ5SRD1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TIMM23BQ5SRD1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TIMM23BQ5SRD1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms