Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQS7

SH2D4B, SH2 domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D4BQ5SQS7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH2D4BQ5SQS7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH2D4BQ5SQS7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH2D4BQ5SQS7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH2D4BQ5SQS7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH2D4BQ5SQS7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH2D4BQ5SQS7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH2D4BQ5SQS7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH2D4BQ5SQS7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH2D4BQ5SQS7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH2D4BQ5SQS7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH2D4BQ5SQS7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH2D4BQ5SQS7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH2D4BQ5SQS7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH2D4BQ5SQS7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH2D4BQ5SQS7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH2D4BQ5SQS7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH2D4BQ5SQS7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH2D4BQ5SQS7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH2D4BQ5SQS7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH2D4BQ5SQS7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH2D4BQ5SQS7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH2D4BQ5SQS7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH2D4BQ5SQS7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH2D4BQ5SQS7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH2D4BQ5SQS7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH2D4BQ5SQS7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH2D4BQ5SQS7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH2D4BQ5SQS7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH2D4BQ5SQS7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH2D4BQ5SQS7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH2D4BQ5SQS7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH2D4BQ5SQS7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH2D4BQ5SQS7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH2D4BQ5SQS7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH2D4BQ5SQS7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH2D4BQ5SQS7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH2D4BQ5SQS7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH2D4BQ5SQS7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH2D4BQ5SQS7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH2D4BQ5SQS7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SH2D4BQ5SQS7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SH2D4BQ5SQS7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SH2D4BQ5SQS7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH2D4BQ5SQS7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms