Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC158Q5M9N0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC158Q5M9N0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC158Q5M9N0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC158Q5M9N0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC158Q5M9N0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC158Q5M9N0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC158Q5M9N0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC158Q5M9N0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC158Q5M9N0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC158Q5M9N0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC158Q5M9N0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC158Q5M9N0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC158Q5M9N0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC158Q5M9N0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC158Q5M9N0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC158Q5M9N0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC158Q5M9N0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC158Q5M9N0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC158Q5M9N0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC158Q5M9N0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC158Q5M9N0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC158Q5M9N0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC158Q5M9N0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC158Q5M9N0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC158Q5M9N0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC158Q5M9N0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC158Q5M9N0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC158Q5M9N0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC158Q5M9N0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC158Q5M9N0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC158Q5M9N0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC158Q5M9N0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC158Q5M9N0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC158Q5M9N0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC158Q5M9N0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC158Q5M9N0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC158Q5M9N0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC158Q5M9N0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC158Q5M9N0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC158Q5M9N0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC158Q5M9N0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC158Q5M9N0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC158Q5M9N0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC158Q5M9N0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC158Q5M9N0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC158Q5M9N0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC158Q5M9N0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC158Q5M9N0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC158Q5M9N0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC158Q5M9N0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC158Q5M9N0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC158Q5M9N0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC158Q5M9N0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC158Q5M9N0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC158Q5M9N0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC158Q5M9N0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC158Q5M9N0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC158Q5M9N0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC158Q5M9N0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC158Q5M9N0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC158Q5M9N0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC158Q5M9N0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC158Q5M9N0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC158Q5M9N0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC158Q5M9N0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CCDC158Q5M9N0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC158Q5M9N0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC158Q5M9N0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC158Q5M9N0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC158Q5M9N0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC158Q5M9N0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC158Q5M9N0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC158Q5M9N0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC158Q5M9N0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC158Q5M9N0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC158Q5M9N0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC158Q5M9N0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC158Q5M9N0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC158Q5M9N0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC158Q5M9N0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC158Q5M9N0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC158Q5M9N0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC158Q5M9N0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC158Q5M9N0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC158Q5M9N0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC158Q5M9N0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC158Q5M9N0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC158Q5M9N0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC158Q5M9N0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC158Q5M9N0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC158Q5M9N0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC158Q5M9N0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC158Q5M9N0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC158Q5M9N0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC158Q5M9N0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC158Q5M9N0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC158Q5M9N0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC158Q5M9N0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC158Q5M9N0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms