Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSZ5

PRRC2B, Protein PRRC2B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC2BQ5JSZ5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRRC2BQ5JSZ5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRRC2BQ5JSZ5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRRC2BQ5JSZ5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRRC2BQ5JSZ5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRRC2BQ5JSZ5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRRC2BQ5JSZ5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRRC2BQ5JSZ5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PRRC2BQ5JSZ5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRRC2BQ5JSZ5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRRC2BQ5JSZ5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRRC2BQ5JSZ5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRRC2BQ5JSZ5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRRC2BQ5JSZ5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PRRC2BQ5JSZ5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRRC2BQ5JSZ5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PRRC2BQ5JSZ5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PRRC2BQ5JSZ5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRRC2BQ5JSZ5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRRC2BQ5JSZ5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRRC2BQ5JSZ5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PRRC2BQ5JSZ5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRRC2BQ5JSZ5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRRC2BQ5JSZ5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PRRC2BQ5JSZ5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PRRC2BQ5JSZ5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRRC2BQ5JSZ5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRRC2BQ5JSZ5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRRC2BQ5JSZ5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRRC2BQ5JSZ5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PRRC2BQ5JSZ5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRRC2BQ5JSZ5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRRC2BQ5JSZ5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRRC2BQ5JSZ5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRRC2BQ5JSZ5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRRC2BQ5JSZ5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRRC2BQ5JSZ5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PRRC2BQ5JSZ5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRRC2BQ5JSZ5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRRC2BQ5JSZ5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PRRC2BQ5JSZ5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRRC2BQ5JSZ5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRRC2BQ5JSZ5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRRC2BQ5JSZ5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRRC2BQ5JSZ5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PRRC2BQ5JSZ5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRRC2BQ5JSZ5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRRC2BQ5JSZ5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRRC2BQ5JSZ5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRRC2BQ5JSZ5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRRC2BQ5JSZ5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRRC2BQ5JSZ5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PRRC2BQ5JSZ5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRRC2BQ5JSZ5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRRC2BQ5JSZ5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRRC2BQ5JSZ5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRRC2BQ5JSZ5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRRC2BQ5JSZ5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRRC2BQ5JSZ5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PRRC2BQ5JSZ5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRRC2BQ5JSZ5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PRRC2BQ5JSZ5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRRC2BQ5JSZ5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRRC2BQ5JSZ5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRRC2BQ5JSZ5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRRC2BQ5JSZ5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRRC2BQ5JSZ5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRRC2BQ5JSZ5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRRC2BQ5JSZ5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRRC2BQ5JSZ5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRRC2BQ5JSZ5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRRC2BQ5JSZ5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRRC2BQ5JSZ5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRRC2BQ5JSZ5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRRC2BQ5JSZ5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRRC2BQ5JSZ5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRRC2BQ5JSZ5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PRRC2BQ5JSZ5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRRC2BQ5JSZ5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRRC2BQ5JSZ5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRRC2BQ5JSZ5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRRC2BQ5JSZ5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRRC2BQ5JSZ5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRRC2BQ5JSZ5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRRC2BQ5JSZ5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRRC2BQ5JSZ5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRRC2BQ5JSZ5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRRC2BQ5JSZ5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRRC2BQ5JSZ5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRRC2BQ5JSZ5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRRC2BQ5JSZ5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRRC2BQ5JSZ5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRRC2BQ5JSZ5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRRC2BQ5JSZ5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRRC2BQ5JSZ5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRRC2BQ5JSZ5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRRC2BQ5JSZ5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRRC2BQ5JSZ5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRRC2BQ5JSZ5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRRC2BQ5JSZ5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms