Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL39P5Q59GN2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPL39P5Q59GN2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL39P5Q59GN2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL39P5Q59GN2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL39P5Q59GN2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL39P5Q59GN2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL39P5Q59GN2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL39P5Q59GN2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL39P5Q59GN2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL39P5Q59GN2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL39P5Q59GN2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL39P5Q59GN2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL39P5Q59GN2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL39P5Q59GN2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL39P5Q59GN2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL39P5Q59GN2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL39P5Q59GN2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL39P5Q59GN2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL39P5Q59GN2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL39P5Q59GN2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL39P5Q59GN2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL39P5Q59GN2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL39P5Q59GN2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL39P5Q59GN2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL39P5Q59GN2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL39P5Q59GN2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL39P5Q59GN2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL39P5Q59GN2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL39P5Q59GN2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL39P5Q59GN2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL39P5Q59GN2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL39P5Q59GN2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL39P5Q59GN2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL39P5Q59GN2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL39P5Q59GN2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL39P5Q59GN2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL39P5Q59GN2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL39P5Q59GN2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL39P5Q59GN2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL39P5Q59GN2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL39P5Q59GN2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL39P5Q59GN2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL39P5Q59GN2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL39P5Q59GN2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL39P5Q59GN2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms