Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC93Q567U6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC93Q567U6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC93Q567U6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC93Q567U6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC93Q567U6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC93Q567U6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC93Q567U6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC93Q567U6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC93Q567U6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC93Q567U6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC93Q567U6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC93Q567U6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC93Q567U6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC93Q567U6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC93Q567U6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC93Q567U6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC93Q567U6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC93Q567U6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CCDC93Q567U6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC93Q567U6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC93Q567U6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC93Q567U6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC93Q567U6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC93Q567U6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC93Q567U6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC93Q567U6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC93Q567U6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC93Q567U6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC93Q567U6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC93Q567U6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC93Q567U6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC93Q567U6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC93Q567U6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC93Q567U6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC93Q567U6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC93Q567U6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC93Q567U6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC93Q567U6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC93Q567U6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC93Q567U6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC93Q567U6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC93Q567U6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC93Q567U6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC93Q567U6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC93Q567U6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC93Q567U6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC93Q567U6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC93Q567U6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC93Q567U6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC93Q567U6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC93Q567U6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC93Q567U6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC93Q567U6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC93Q567U6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC93Q567U6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC93Q567U6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC93Q567U6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC93Q567U6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC93Q567U6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC93Q567U6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC93Q567U6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC93Q567U6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC93Q567U6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC93Q567U6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC93Q567U6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC93Q567U6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC93Q567U6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC93Q567U6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC93Q567U6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC93Q567U6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC93Q567U6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC93Q567U6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC93Q567U6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC93Q567U6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC93Q567U6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC93Q567U6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC93Q567U6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC93Q567U6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC93Q567U6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC93Q567U6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC93Q567U6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC93Q567U6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC93Q567U6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC93Q567U6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC93Q567U6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC93Q567U6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC93Q567U6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC93Q567U6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC93Q567U6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC93Q567U6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC93Q567U6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC93Q567U6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC93Q567U6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC93Q567U6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC93Q567U6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC93Q567U6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC93Q567U6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC93Q567U6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC93Q567U6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms