Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COBLL1Q53SF7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COBLL1Q53SF7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COBLL1Q53SF7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COBLL1Q53SF7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COBLL1Q53SF7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COBLL1Q53SF7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COBLL1Q53SF7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COBLL1Q53SF7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COBLL1Q53SF7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COBLL1Q53SF7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COBLL1Q53SF7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COBLL1Q53SF7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COBLL1Q53SF7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COBLL1Q53SF7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COBLL1Q53SF7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
COBLL1Q53SF7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COBLL1Q53SF7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COBLL1Q53SF7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COBLL1Q53SF7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COBLL1Q53SF7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COBLL1Q53SF7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
COBLL1Q53SF7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COBLL1Q53SF7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COBLL1Q53SF7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COBLL1Q53SF7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COBLL1Q53SF7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
COBLL1Q53SF7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
COBLL1Q53SF7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COBLL1Q53SF7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COBLL1Q53SF7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COBLL1Q53SF7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COBLL1Q53SF7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
COBLL1Q53SF7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
COBLL1Q53SF7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
COBLL1Q53SF7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COBLL1Q53SF7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
COBLL1Q53SF7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
COBLL1Q53SF7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
COBLL1Q53SF7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
COBLL1Q53SF7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COBLL1Q53SF7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COBLL1Q53SF7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COBLL1Q53SF7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COBLL1Q53SF7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COBLL1Q53SF7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COBLL1Q53SF7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COBLL1Q53SF7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
COBLL1Q53SF7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
COBLL1Q53SF7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COBLL1Q53SF7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COBLL1Q53SF7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COBLL1Q53SF7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COBLL1Q53SF7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COBLL1Q53SF7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COBLL1Q53SF7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COBLL1Q53SF7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COBLL1Q53SF7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COBLL1Q53SF7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COBLL1Q53SF7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COBLL1Q53SF7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
COBLL1Q53SF7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COBLL1Q53SF7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COBLL1Q53SF7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COBLL1Q53SF7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COBLL1Q53SF7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
COBLL1Q53SF7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
COBLL1Q53SF7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COBLL1Q53SF7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COBLL1Q53SF7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
COBLL1Q53SF7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
COBLL1Q53SF7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COBLL1Q53SF7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COBLL1Q53SF7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
COBLL1Q53SF7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COBLL1Q53SF7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COBLL1Q53SF7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COBLL1Q53SF7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COBLL1Q53SF7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COBLL1Q53SF7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COBLL1Q53SF7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COBLL1Q53SF7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COBLL1Q53SF7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COBLL1Q53SF7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COBLL1Q53SF7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COBLL1Q53SF7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COBLL1Q53SF7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COBLL1Q53SF7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COBLL1Q53SF7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COBLL1Q53SF7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COBLL1Q53SF7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COBLL1Q53SF7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COBLL1Q53SF7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COBLL1Q53SF7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COBLL1Q53SF7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COBLL1Q53SF7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COBLL1Q53SF7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COBLL1Q53SF7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COBLL1Q53SF7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COBLL1Q53SF7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms