Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIT2

PUS10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS10Q3MIT2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PUS10Q3MIT2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PUS10Q3MIT2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PUS10Q3MIT2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PUS10Q3MIT2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PUS10Q3MIT2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PUS10Q3MIT2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PUS10Q3MIT2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PUS10Q3MIT2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PUS10Q3MIT2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PUS10Q3MIT2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PUS10Q3MIT2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PUS10Q3MIT2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PUS10Q3MIT2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PUS10Q3MIT2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PUS10Q3MIT2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PUS10Q3MIT2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PUS10Q3MIT2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PUS10Q3MIT2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PUS10Q3MIT2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PUS10Q3MIT2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PUS10Q3MIT2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PUS10Q3MIT2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PUS10Q3MIT2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PUS10Q3MIT2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PUS10Q3MIT2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PUS10Q3MIT2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PUS10Q3MIT2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PUS10Q3MIT2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PUS10Q3MIT2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PUS10Q3MIT2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PUS10Q3MIT2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PUS10Q3MIT2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PUS10Q3MIT2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PUS10Q3MIT2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PUS10Q3MIT2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PUS10Q3MIT2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PUS10Q3MIT2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PUS10Q3MIT2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PUS10Q3MIT2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PUS10Q3MIT2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PUS10Q3MIT2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PUS10Q3MIT2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PUS10Q3MIT2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PUS10Q3MIT2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PUS10Q3MIT2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PUS10Q3MIT2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PUS10Q3MIT2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PUS10Q3MIT2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PUS10Q3MIT2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PUS10Q3MIT2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PUS10Q3MIT2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PUS10Q3MIT2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PUS10Q3MIT2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PUS10Q3MIT2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PUS10Q3MIT2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PUS10Q3MIT2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PUS10Q3MIT2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PUS10Q3MIT2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PUS10Q3MIT2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PUS10Q3MIT2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PUS10Q3MIT2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PUS10Q3MIT2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PUS10Q3MIT2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PUS10Q3MIT2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PUS10Q3MIT2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PUS10Q3MIT2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PUS10Q3MIT2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PUS10Q3MIT2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PUS10Q3MIT2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUS10Q3MIT2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUS10Q3MIT2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUS10Q3MIT2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUS10Q3MIT2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUS10Q3MIT2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUS10Q3MIT2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PUS10Q3MIT2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PUS10Q3MIT2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PUS10Q3MIT2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PUS10Q3MIT2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PUS10Q3MIT2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PUS10Q3MIT2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PUS10Q3MIT2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PUS10Q3MIT2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PUS10Q3MIT2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PUS10Q3MIT2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PUS10Q3MIT2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PUS10Q3MIT2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PUS10Q3MIT2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUS10Q3MIT2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUS10Q3MIT2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUS10Q3MIT2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUS10Q3MIT2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PUS10Q3MIT2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PUS10Q3MIT2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PUS10Q3MIT2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PUS10Q3MIT2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PUS10Q3MIT2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PUS10Q3MIT2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PUS10Q3MIT2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms