Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KLHL40Q2TBA0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KLHL40Q2TBA0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KLHL40Q2TBA0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KLHL40Q2TBA0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KLHL40Q2TBA0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KLHL40Q2TBA0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KLHL40Q2TBA0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KLHL40Q2TBA0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KLHL40Q2TBA0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KLHL40Q2TBA0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KLHL40Q2TBA0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KLHL40Q2TBA0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KLHL40Q2TBA0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KLHL40Q2TBA0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KLHL40Q2TBA0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KLHL40Q2TBA0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KLHL40Q2TBA0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KLHL40Q2TBA0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KLHL40Q2TBA0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KLHL40Q2TBA0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KLHL40Q2TBA0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KLHL40Q2TBA0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KLHL40Q2TBA0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KLHL40Q2TBA0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
KLHL40Q2TBA0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KLHL40Q2TBA0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KLHL40Q2TBA0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KLHL40Q2TBA0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KLHL40Q2TBA0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
KLHL40Q2TBA0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KLHL40Q2TBA0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KLHL40Q2TBA0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KLHL40Q2TBA0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KLHL40Q2TBA0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KLHL40Q2TBA0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KLHL40Q2TBA0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
KLHL40Q2TBA0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KLHL40Q2TBA0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KLHL40Q2TBA0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KLHL40Q2TBA0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KLHL40Q2TBA0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KLHL40Q2TBA0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KLHL40Q2TBA0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KLHL40Q2TBA0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KLHL40Q2TBA0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KLHL40Q2TBA0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KLHL40Q2TBA0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLHL40Q2TBA0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLHL40Q2TBA0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLHL40Q2TBA0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLHL40Q2TBA0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLHL40Q2TBA0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLHL40Q2TBA0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KLHL40Q2TBA0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLHL40Q2TBA0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLHL40Q2TBA0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLHL40Q2TBA0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KLHL40Q2TBA0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KLHL40Q2TBA0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KLHL40Q2TBA0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KLHL40Q2TBA0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KLHL40Q2TBA0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KLHL40Q2TBA0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
KLHL40Q2TBA0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
KLHL40Q2TBA0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KLHL40Q2TBA0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KLHL40Q2TBA0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KLHL40Q2TBA0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KLHL40Q2TBA0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KLHL40Q2TBA0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KLHL40Q2TBA0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
KLHL40Q2TBA0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KLHL40Q2TBA0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KLHL40Q2TBA0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KLHL40Q2TBA0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KLHL40Q2TBA0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KLHL40Q2TBA0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KLHL40Q2TBA0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KLHL40Q2TBA0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KLHL40Q2TBA0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KLHL40Q2TBA0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KLHL40Q2TBA0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KLHL40Q2TBA0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLHL40Q2TBA0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLHL40Q2TBA0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLHL40Q2TBA0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLHL40Q2TBA0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLHL40Q2TBA0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLHL40Q2TBA0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KLHL40Q2TBA0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KLHL40Q2TBA0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KLHL40Q2TBA0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KLHL40Q2TBA0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KLHL40Q2TBA0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KLHL40Q2TBA0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KLHL40Q2TBA0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KLHL40Q2TBA0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KLHL40Q2TBA0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
KLHL40Q2TBA0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms