Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTF1Q16619 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTF1Q16619 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTF1Q16619 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTF1Q16619 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTF1Q16619 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CTF1Q16619 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTF1Q16619 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTF1Q16619 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTF1Q16619 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTF1Q16619 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTF1Q16619 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTF1Q16619 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTF1Q16619 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTF1Q16619 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTF1Q16619 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTF1Q16619 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTF1Q16619 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTF1Q16619 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTF1Q16619 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTF1Q16619 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTF1Q16619 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTF1Q16619 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTF1Q16619 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTF1Q16619 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTF1Q16619 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTF1Q16619 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTF1Q16619 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTF1Q16619 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTF1Q16619 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTF1Q16619 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTF1Q16619 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTF1Q16619 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTF1Q16619 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTF1Q16619 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTF1Q16619 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTF1Q16619 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTF1Q16619 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTF1Q16619 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTF1Q16619 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTF1Q16619 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTF1Q16619 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTF1Q16619 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTF1Q16619 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTF1Q16619 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTF1Q16619 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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CTF1Q16619 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTF1Q16619 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTF1Q16619 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTF1Q16619 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTF1Q16619 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTF1Q16619 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTF1Q16619 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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CTF1Q16619 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTF1Q16619 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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CTF1Q16619 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTF1Q16619 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTF1Q16619 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTF1Q16619 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTF1Q16619 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTF1Q16619 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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CTF1Q16619 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTF1Q16619 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTF1Q16619 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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CTF1Q16619 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTF1Q16619 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTF1Q16619 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTF1Q16619 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTF1Q16619 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTF1Q16619 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTF1Q16619 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTF1Q16619 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTF1Q16619 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTF1Q16619 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTF1Q16619 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTF1Q16619 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTF1Q16619 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTF1Q16619 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTF1Q16619 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTF1Q16619 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTF1Q16619 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CTF1Q16619 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CTF1Q16619 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTF1Q16619 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTF1Q16619 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTF1Q16619 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTF1Q16619 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTF1Q16619 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTF1Q16619 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CTF1Q16619 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTF1Q16619 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CTF1Q16619 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
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