Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TAF1CQ15572 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TAF1CQ15572 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TAF1CQ15572 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TAF1CQ15572 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TAF1CQ15572 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TAF1CQ15572 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TAF1CQ15572 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TAF1CQ15572 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TAF1CQ15572 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TAF1CQ15572 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TAF1CQ15572 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TAF1CQ15572 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TAF1CQ15572 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TAF1CQ15572 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TAF1CQ15572 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TAF1CQ15572 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TAF1CQ15572 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TAF1CQ15572 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TAF1CQ15572 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TAF1CQ15572 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TAF1CQ15572 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TAF1CQ15572 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TAF1CQ15572 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TAF1CQ15572 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TAF1CQ15572 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TAF1CQ15572 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TAF1CQ15572 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TAF1CQ15572 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TAF1CQ15572 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TAF1CQ15572 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TAF1CQ15572 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TAF1CQ15572 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TAF1CQ15572 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TAF1CQ15572 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TAF1CQ15572 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TAF1CQ15572 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TAF1CQ15572 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TAF1CQ15572 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TAF1CQ15572 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TAF1CQ15572 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TAF1CQ15572 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TAF1CQ15572 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TAF1CQ15572 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TAF1CQ15572 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TAF1CQ15572 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TAF1CQ15572 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TAF1CQ15572 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TAF1CQ15572 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TAF1CQ15572 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TAF1CQ15572 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TAF1CQ15572 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TAF1CQ15572 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TAF1CQ15572 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TAF1CQ15572 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TAF1CQ15572 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TAF1CQ15572 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TAF1CQ15572 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TAF1CQ15572 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TAF1CQ15572 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TAF1CQ15572 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TAF1CQ15572 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TAF1CQ15572 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TAF1CQ15572 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TAF1CQ15572 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TAF1CQ15572 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TAF1CQ15572 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TAF1CQ15572 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TAF1CQ15572 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TAF1CQ15572 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TAF1CQ15572 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TAF1CQ15572 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TAF1CQ15572 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TAF1CQ15572 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TAF1CQ15572 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TAF1CQ15572 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TAF1CQ15572 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TAF1CQ15572 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TAF1CQ15572 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TAF1CQ15572 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TAF1CQ15572 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TAF1CQ15572 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TAF1CQ15572 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TAF1CQ15572 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TAF1CQ15572 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TAF1CQ15572 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TAF1CQ15572 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TAF1CQ15572 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TAF1CQ15572 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TAF1CQ15572 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TAF1CQ15572 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TAF1CQ15572 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TAF1CQ15572 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TAF1CQ15572 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TAF1CQ15572 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TAF1CQ15572 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TAF1CQ15572 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TAF1CQ15572 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TAF1CQ15572 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TAF1CQ15572 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
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