Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB35Q15286 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB35Q15286 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB35Q15286 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB35Q15286 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB35Q15286 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB35Q15286 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB35Q15286 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB35Q15286 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
RAB35Q15286 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RAB35Q15286 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB35Q15286 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB35Q15286 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB35Q15286 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB35Q15286 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB35Q15286 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB35Q15286 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB35Q15286 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB35Q15286 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB35Q15286 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB35Q15286 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB35Q15286 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB35Q15286 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB35Q15286 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB35Q15286 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB35Q15286 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB35Q15286 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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RAB35Q15286 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB35Q15286 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB35Q15286 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB35Q15286 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB35Q15286 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB35Q15286 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB35Q15286 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB35Q15286 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB35Q15286 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB35Q15286 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB35Q15286 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB35Q15286 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB35Q15286 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB35Q15286 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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RAB35Q15286 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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RAB35Q15286 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAB35Q15286 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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RAB35Q15286 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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RAB35Q15286 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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RAB35Q15286 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB35Q15286 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB35Q15286 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB35Q15286 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB35Q15286 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAB35Q15286 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAB35Q15286 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAB35Q15286 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAB35Q15286 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAB35Q15286 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAB35Q15286 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAB35Q15286 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAB35Q15286 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAB35Q15286 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAB35Q15286 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB35Q15286 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB35Q15286 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB35Q15286 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB35Q15286 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB35Q15286 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB35Q15286 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB35Q15286 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAB35Q15286 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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RAB35Q15286 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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