Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LAPTM4AQ15012 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LAPTM4AQ15012 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LAPTM4AQ15012 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAPTM4AQ15012 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LAPTM4AQ15012 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LAPTM4AQ15012 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAPTM4AQ15012 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAPTM4AQ15012 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAPTM4AQ15012 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAPTM4AQ15012 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAPTM4AQ15012 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAPTM4AQ15012 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAPTM4AQ15012 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAPTM4AQ15012 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAPTM4AQ15012 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAPTM4AQ15012 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAPTM4AQ15012 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAPTM4AQ15012 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAPTM4AQ15012 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAPTM4AQ15012 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAPTM4AQ15012 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAPTM4AQ15012 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAPTM4AQ15012 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAPTM4AQ15012 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAPTM4AQ15012 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAPTM4AQ15012 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LAPTM4AQ15012 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAPTM4AQ15012 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAPTM4AQ15012 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAPTM4AQ15012 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAPTM4AQ15012 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAPTM4AQ15012 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAPTM4AQ15012 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAPTM4AQ15012 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAPTM4AQ15012 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAPTM4AQ15012 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAPTM4AQ15012 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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