Protein–RNA interactions for Protein: Q14CS0

UBXN2B, UBX domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2BQ14CS0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN2BQ14CS0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN2BQ14CS0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN2BQ14CS0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN2BQ14CS0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN2BQ14CS0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN2BQ14CS0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN2BQ14CS0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN2BQ14CS0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN2BQ14CS0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN2BQ14CS0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN2BQ14CS0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN2BQ14CS0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBXN2BQ14CS0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBXN2BQ14CS0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBXN2BQ14CS0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBXN2BQ14CS0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBXN2BQ14CS0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBXN2BQ14CS0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBXN2BQ14CS0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN2BQ14CS0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN2BQ14CS0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN2BQ14CS0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN2BQ14CS0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN2BQ14CS0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN2BQ14CS0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN2BQ14CS0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN2BQ14CS0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN2BQ14CS0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN2BQ14CS0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN2BQ14CS0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN2BQ14CS0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBXN2BQ14CS0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBXN2BQ14CS0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBXN2BQ14CS0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN2BQ14CS0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN2BQ14CS0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN2BQ14CS0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN2BQ14CS0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN2BQ14CS0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN2BQ14CS0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN2BQ14CS0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN2BQ14CS0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN2BQ14CS0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN2BQ14CS0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN2BQ14CS0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN2BQ14CS0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN2BQ14CS0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN2BQ14CS0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
UBXN2BQ14CS0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBXN2BQ14CS0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
UBXN2BQ14CS0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
UBXN2BQ14CS0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN2BQ14CS0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN2BQ14CS0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN2BQ14CS0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN2BQ14CS0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN2BQ14CS0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN2BQ14CS0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN2BQ14CS0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN2BQ14CS0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN2BQ14CS0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN2BQ14CS0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN2BQ14CS0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN2BQ14CS0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN2BQ14CS0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN2BQ14CS0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN2BQ14CS0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN2BQ14CS0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN2BQ14CS0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN2BQ14CS0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN2BQ14CS0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN2BQ14CS0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN2BQ14CS0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN2BQ14CS0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN2BQ14CS0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN2BQ14CS0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN2BQ14CS0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN2BQ14CS0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN2BQ14CS0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN2BQ14CS0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBXN2BQ14CS0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBXN2BQ14CS0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBXN2BQ14CS0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBXN2BQ14CS0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBXN2BQ14CS0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBXN2BQ14CS0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBXN2BQ14CS0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBXN2BQ14CS0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBXN2BQ14CS0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBXN2BQ14CS0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBXN2BQ14CS0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBXN2BQ14CS0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBXN2BQ14CS0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UBXN2BQ14CS0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UBXN2BQ14CS0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBXN2BQ14CS0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBXN2BQ14CS0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBXN2BQ14CS0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBXN2BQ14CS0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms