Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLF9Q13886 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLF9Q13886 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLF9Q13886 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLF9Q13886 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLF9Q13886 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLF9Q13886 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLF9Q13886 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLF9Q13886 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLF9Q13886 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLF9Q13886 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLF9Q13886 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLF9Q13886 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLF9Q13886 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLF9Q13886 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLF9Q13886 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLF9Q13886 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLF9Q13886 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLF9Q13886 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLF9Q13886 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLF9Q13886 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLF9Q13886 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLF9Q13886 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLF9Q13886 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLF9Q13886 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLF9Q13886 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLF9Q13886 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLF9Q13886 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLF9Q13886 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLF9Q13886 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLF9Q13886 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLF9Q13886 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLF9Q13886 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLF9Q13886 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLF9Q13886 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLF9Q13886 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KLF9Q13886 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLF9Q13886 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLF9Q13886 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLF9Q13886 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLF9Q13886 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLF9Q13886 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLF9Q13886 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLF9Q13886 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLF9Q13886 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KLF9Q13886 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLF9Q13886 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLF9Q13886 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLF9Q13886 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLF9Q13886 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLF9Q13886 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLF9Q13886 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLF9Q13886 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLF9Q13886 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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