Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FHL3Q13643 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FHL3Q13643 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FHL3Q13643 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FHL3Q13643 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FHL3Q13643 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FHL3Q13643 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FHL3Q13643 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FHL3Q13643 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FHL3Q13643 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FHL3Q13643 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FHL3Q13643 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FHL3Q13643 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FHL3Q13643 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FHL3Q13643 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FHL3Q13643 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FHL3Q13643 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FHL3Q13643 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FHL3Q13643 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FHL3Q13643 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FHL3Q13643 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FHL3Q13643 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FHL3Q13643 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FHL3Q13643 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FHL3Q13643 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FHL3Q13643 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FHL3Q13643 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FHL3Q13643 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FHL3Q13643 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FHL3Q13643 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FHL3Q13643 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FHL3Q13643 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FHL3Q13643 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FHL3Q13643 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FHL3Q13643 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FHL3Q13643 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FHL3Q13643 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FHL3Q13643 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FHL3Q13643 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FHL3Q13643 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FHL3Q13643 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FHL3Q13643 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FHL3Q13643 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FHL3Q13643 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FHL3Q13643 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FHL3Q13643 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FHL3Q13643 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FHL3Q13643 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms