Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SREBF2Q12772 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SREBF2Q12772 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SREBF2Q12772 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SREBF2Q12772 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SREBF2Q12772 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SREBF2Q12772 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SREBF2Q12772 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SREBF2Q12772 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SREBF2Q12772 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SREBF2Q12772 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SREBF2Q12772 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SREBF2Q12772 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SREBF2Q12772 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SREBF2Q12772 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SREBF2Q12772 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SREBF2Q12772 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SREBF2Q12772 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SREBF2Q12772 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SREBF2Q12772 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SREBF2Q12772 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SREBF2Q12772 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SREBF2Q12772 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SREBF2Q12772 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SREBF2Q12772 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SREBF2Q12772 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SREBF2Q12772 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SREBF2Q12772 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SREBF2Q12772 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SREBF2Q12772 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SREBF2Q12772 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SREBF2Q12772 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SREBF2Q12772 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SREBF2Q12772 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SREBF2Q12772 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SREBF2Q12772 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SREBF2Q12772 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SREBF2Q12772 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SREBF2Q12772 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SREBF2Q12772 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SREBF2Q12772 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SREBF2Q12772 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SREBF2Q12772 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SREBF2Q12772 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SREBF2Q12772 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SREBF2Q12772 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
SREBF2Q12772 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SREBF2Q12772 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SREBF2Q12772 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SREBF2Q12772 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SREBF2Q12772 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SREBF2Q12772 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SREBF2Q12772 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SREBF2Q12772 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SREBF2Q12772 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SREBF2Q12772 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SREBF2Q12772 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SREBF2Q12772 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SREBF2Q12772 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SREBF2Q12772 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SREBF2Q12772 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SREBF2Q12772 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SREBF2Q12772 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SREBF2Q12772 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SREBF2Q12772 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SREBF2Q12772 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SREBF2Q12772 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SREBF2Q12772 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SREBF2Q12772 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SREBF2Q12772 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SREBF2Q12772 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SREBF2Q12772 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SREBF2Q12772 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SREBF2Q12772 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SREBF2Q12772 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SREBF2Q12772 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SREBF2Q12772 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SREBF2Q12772 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SREBF2Q12772 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SREBF2Q12772 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SREBF2Q12772 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SREBF2Q12772 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SREBF2Q12772 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SREBF2Q12772 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SREBF2Q12772 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SREBF2Q12772 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SREBF2Q12772 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SREBF2Q12772 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SREBF2Q12772 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SREBF2Q12772 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SREBF2Q12772 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SREBF2Q12772 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SREBF2Q12772 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SREBF2Q12772 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SREBF2Q12772 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SREBF2Q12772 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SREBF2Q12772 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SREBF2Q12772 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SREBF2Q12772 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SREBF2Q12772 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
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