Protein–RNA interactions for Protein: Q07011

TNFRSF9, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF9Q07011 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFRSF9Q07011 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFRSF9Q07011 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 574.3 ms