Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HERVK_113P63132 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERVK_113P63132 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERVK_113P63132 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERVK_113P63132 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HERVK_113P63132 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERVK_113P63132 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERVK_113P63132 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERVK_113P63132 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERVK_113P63132 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERVK_113P63132 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERVK_113P63132 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERVK_113P63132 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERVK_113P63132 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERVK_113P63132 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERVK_113P63132 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERVK_113P63132 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERVK_113P63132 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HERVK_113P63132 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERVK_113P63132 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERVK_113P63132 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERVK_113P63132 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERVK_113P63132 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERVK_113P63132 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERVK_113P63132 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERVK_113P63132 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERVK_113P63132 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERVK_113P63132 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERVK_113P63132 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERVK_113P63132 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERVK_113P63132 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERVK_113P63132 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERVK_113P63132 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERVK_113P63132 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERVK_113P63132 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERVK_113P63132 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERVK_113P63132 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERVK_113P63132 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERVK_113P63132 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HERVK_113P63132 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERVK_113P63132 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERVK_113P63132 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERVK_113P63132 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERVK_113P63132 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERVK_113P63132 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERVK_113P63132 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERVK_113P63132 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERVK_113P63132 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HERVK_113P63132 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERVK_113P63132 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERVK_113P63132 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERVK_113P63132 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERVK_113P63132 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERVK_113P63132 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERVK_113P63132 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERVK_113P63132 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERVK_113P63132 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERVK_113P63132 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERVK_113P63132 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERVK_113P63132 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HERVK_113P63132 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HERVK_113P63132 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HERVK_113P63132 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HERVK_113P63132 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HERVK_113P63132 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HERVK_113P63132 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HERVK_113P63132 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HERVK_113P63132 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HERVK_113P63132 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERVK_113P63132 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERVK_113P63132 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERVK_113P63132 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERVK_113P63132 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERVK_113P63132 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERVK_113P63132 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERVK_113P63132 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERVK_113P63132 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERVK_113P63132 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERVK_113P63132 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERVK_113P63132 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERVK_113P63132 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERVK_113P63132 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERVK_113P63132 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERVK_113P63132 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERVK_113P63132 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERVK_113P63132 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERVK_113P63132 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERVK_113P63132 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HERVK_113P63132 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERVK_113P63132 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERVK_113P63132 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERVK_113P63132 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERVK_113P63132 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERVK_113P63132 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERVK_113P63132 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERVK_113P63132 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HERVK_113P63132 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERVK_113P63132 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERVK_113P63132 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms