Protein–RNA interactions for Protein: P62277

RPS13, 40S ribosomal protein S13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS13P62277 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS13P62277 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS13P62277 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS13P62277 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS13P62277 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS13P62277 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS13P62277 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS13P62277 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS13P62277 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS13P62277 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS13P62277 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS13P62277 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS13P62277 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS13P62277 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS13P62277 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS13P62277 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS13P62277 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS13P62277 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS13P62277 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS13P62277 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS13P62277 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS13P62277 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS13P62277 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS13P62277 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS13P62277 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS13P62277 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS13P62277 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS13P62277 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS13P62277 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS13P62277 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS13P62277 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS13P62277 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS13P62277 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS13P62277 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS13P62277 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS13P62277 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS13P62277 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS13P62277 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS13P62277 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS13P62277 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS13P62277 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS13P62277 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS13P62277 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS13P62277 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPS13P62277 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS13P62277 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS13P62277 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS13P62277 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS13P62277 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS13P62277 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS13P62277 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS13P62277 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS13P62277 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS13P62277 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS13P62277 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS13P62277 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS13P62277 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS13P62277 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS13P62277 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS13P62277 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS13P62277 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS13P62277 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS13P62277 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS13P62277 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS13P62277 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS13P62277 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS13P62277 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS13P62277 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS13P62277 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS13P62277 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS13P62277 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS13P62277 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS13P62277 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS13P62277 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS13P62277 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS13P62277 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS13P62277 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS13P62277 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS13P62277 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS13P62277 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS13P62277 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS13P62277 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS13P62277 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS13P62277 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS13P62277 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS13P62277 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS13P62277 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS13P62277 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS13P62277 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS13P62277 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS13P62277 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS13P62277 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS13P62277 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS13P62277 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS13P62277 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS13P62277 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS13P62277 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS13P62277 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS13P62277 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS13P62277 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms